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Je vais effectuer une analyse différentielle d'expression RNA seq et un enrichissement de voies
Bioinformaticien
Je me spécialise en bioinformatique et analyse basée sur les données, avec une expérience en traitement de données NGS dans la transcriptomique, la génomique et la métagénomique. J’ai également une so...
À propos de ce service
J’aide les étudiants et les chercheurs avec une analyse bioinformatique professionnelle et des données de transcriptomique. Les services incluent l’analyse RNA-seq, l’expression différentielle, le support pour l’analyse de variants, l’analyse statistique, la PCA, les heatmaps, l’enrichissement de voies, et des visualisations prêtes pour publication utilisant R, Python, et des workflows bioinformatiques en ligne de commande Linux. Je travaille avec des matrices de comptage traitées ainsi que des fichiers FASTQ bruts pour des jeux de données de petite à moyenne taille. La communication claire, des résultats précis et des sorties organisées sont prioritaires dans chaque projet. Veuillez me contacter avant de commander pour discuter de votre jeu de données et de vos besoins.
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FAQ
Traduction automatique
Avec quel type de jeux de données travaillez-vous ?
Je travaille avec RNA-seq, transcriptomique, expression différentielle, et jeux de données NGS de petite à moyenne taille. Je peux utiliser des matrices de comptage traitées ou des fichiers FASTQ bruts selon le pack choisi.
Quels fichiers dois-je fournir ?
Veuillez fournir : fichiers FASTQ ou matrice de comptage métadonnées des échantillons / étiquettes de groupe conception expérimentale information sur l’organisme / référence (si disponible)
Ai-je besoin de connaissances en bioinformatique pour commander ?
Non. Je peux vous aider à expliquer le workflow, les résultats et les visualisations de manière claire et adaptée à la recherche.
Pouvez-vous analyser de grands ensembles de données ?
Pour des jeux de données plus grands ou très complexes, veuillez me contacter avant de commander afin que je puisse examiner les exigences informatiques et fournir une offre personnalisée si nécessaire.
Quels résultats vais-je recevoir ?
Selon le pack, vous pouvez recevoir : tableaux DEG graphes PCA heatmaps volcano plots résultats d’enrichissement de voies rapports QC figures prêtes pour publication rapports synthétiques
Quels outils utilisez-vous ?
Les outils couramment utilisés incluent : DESeq2 STAR featureCounts R Python workflows Linux/WSL
Dois-je vous contacter avant de passer une commande ?
Oui, surtout pour des workflows personnalisés, de grands jeux de données, plusieurs comparaisons ou projets avancés de transcriptomique.
