Je réaliserai une analyse de données de métagénomique et de microbiome

Oui, je fournis des visualisations complètes comprenant des diagrammes en barres, des heatmaps et des courbes de rarefaction pour illustrer clairement les résultats.

Je peux analyser une large gamme de données biologiques, y compris RNA-Seq, DNA-Seq, séquençage du génome entier (WGS), séquençage de l’exome entier (WES), métagénomique, 16S/18S rRNA, ChIP-Seq, et plus encore.

Oui, je gère l’ensemble du pipeline, du prétraitement des données brutes (contrôle de qualité, trimming, filtrage) aux analyses avancées telles que l’expression différentielle, l’appel de variants et l’annotation fonctionnelle.

J’utilise une variété d’outils tels que R, Python, Bioconductor, Galaxy, FastQC, GATK, BLAST, et bien d’autres, selon les besoins spécifiques du projet.

Je suis les meilleures pratiques en bioinformatique, garantissant précision, reproductibilité et documentation complète de toutes les étapes d’analyse. Je réalise également plusieurs contrôles de qualité tout au long du processus pour assurer l’intégrité des données et la validité des résultats.

Absolument ! Je propose la visualisation de données (par exemple heatmaps, graphiques PCA, graphiques en volcan) ainsi que l’analyse en aval comme l’enrichissement de jeux de gènes (GSEA) et l’analyse de voies KEGG pour vous aider à interpréter la signification biologique de vos résultats.

J’accepte la plupart des formats de données bioinformatiques standards, y compris FASTQ, BAM, VCF, CSV, GFF, etc. Les résultats peuvent être livrés dans le format de votre choix, et je peux également fournir des rapports complets ou des scripts personnalisés pour une analyse supplémentaire de votre côté.

Oui ! Je peux développer des pipelines bioinformatiques sur mesure adaptés à vos besoins de recherche spécifiques. Faites-moi simplement part de vos objectifs, et nous pourrons concevoir un workflow qui répond à vos exigences.