Je vais effectuer une métagénomique, microbiome, analyse RNA seq

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Bioinformaticien expert, NGS, RNA Seq et analyse de métagénomique

Je suis un bioinformaticien professionnel avec une solide expertise dans l'analyse de données NGS. Je me spécialise dans le séquençage métagénomique, la métagénomique shotgun et l'analyse du microbiom...
À propos de ce service

Je réaliserai une analyse bioinformatique experte, RNA-Seq, scRNA-Seq, métagénomique et données NGS.

En tant que bioinformaticien professionnel, je fournis des analyses de haute qualité, reproductibles, pour des projets de recherche, académiques et industriels. Que vous disposiez de données de séquençage brutes ou que vous ayez besoin d’informations biologiques approfondies, je transformerai vos données en résultats clairs, prêts à être publiés.

Les services incluent :

  • Analyse de RNA-Seq en bulk et en cellule unique (scRNA-Seq) : expression différentielle, clustering, enrichment de voies
  • Analyse de métagénomique et microbiome : 16S rRNA, ITS, métagénomique shotgun, profilage taxonomique et analyse de la diversité
  • Traitement de données NGS / WGS, détection de variants et annotation
  • Analyse de l’expression génique, transcriptomique et annotation fonctionnelle

Outils et technologies :

  • R / Bioconductor : DESeq2, edgeR, Seurat, clusterProfiler, limma
  • QIIME2, Mothur, Kraken2, MetaPhlAn
  • Python : Scanpy, Pandas, Biopython
  • Outils d’alignement et de contrôle qualité : FastQC, Trimmomatic, STAR, HISAT2

Livrables :

  • Rapports complets de contrôle qualité et de prétraitement
  • Figures et visualisations de qualité publication (cartes de chaleur, diagrammes en volcan, PCA, arbres phylogénétiques, etc.)
  • Rapport HTML/PDF détaillé avec résultats statistiques et interprétation biologique


Technologie:

Excel

Google Data Studio

Google Sheets

Type d'analyse:

Analyse quantitative

Analyse qualitative

Expertise:

Conception expérimentale

Algorithmes

Prévision

Langage de programmation:

Python

R

SPSS

SQL

Java

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