Je vais faire une analyse d'expression différentielle RNA seq et des plots des DESeq2
Analyste en bioinformatique RNA Seq, docking moléculaire et simulations MD
À propos de ce service
Bienvenue dans mon service de biologie computationnelle et transcriptomique !
Vous recherchez une analyse précise, prête à être publiée, des données de séquençage ARN (RNA-Seq) ? Je propose des pipelines transcriptomiques complets utilisant des outils de biologie computationnelle standard de l'industrie en Linux Bash, R et Python.
Services que je propose :
Contrôle de qualité et trimming (FastQC, Trimmomatic)
Alignement des lectures avec reconnaissance des épissages (HISAT2)
Quantification des gènes (featureCounts)
Analyse d'expression différentielle (DESeq2 en R)
Visualisations haute résolution (volcano plots, heatmaps groupés, PCA)
Analyse d'enrichissement fonctionnel (analyse de voies GO et KEGG)
Ce que vous recevrez :
1. Jeux de données nettoyés et tableaux Excel annotés des DEG avec changements de pli et p-values ajustées.
2. Graphiques vectoriels/PNG haute résolution (300+ DPI) prêts pour publication.
3. Scripts R reproductibles et bien commentés.
4. Rapport analytique PDF résumé.
Veuillez me contacter avant de passer commande pour discuter de la taille de votre jeu de données et de vos besoins en projet !
Mon portfolio
FAQ
Traduction automatique
Quels fichiers d'entrée dois-je fournir ?
Vous pouvez fournir des fichiers FASTQ bruts ou une matrice de comptage de gènes accompagnée de votre tableau de conception expérimentale (échantillons témoins vs traités).
Vais-je recevoir le code R reproductible ?
Oui, des scripts R complets et propres avec commentaires sont fournis dans les packages standard et premium pour une transparence et une reproductibilité totales.

