Je vais faire une analyse d'expression différentielle RNA seq et des plots des DESeq2

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Analyste en bioinformatique RNA Seq, docking moléculaire et simulations MD

Je suis un biologiste computationnel spécialisé en transcriptomique RNA-Seq, docking moléculaire et simulations de docking moléculaire. Je travaille avec des pipelines Linux Bash, R (DESeq2/Bioconduct...
À propos de ce service

Bienvenue dans mon service de biologie computationnelle et transcriptomique !


Vous recherchez une analyse précise, prête à être publiée, des données de séquençage ARN (RNA-Seq) ? Je propose des pipelines transcriptomiques complets utilisant des outils de biologie computationnelle standard de l'industrie en Linux Bash, R et Python.


Services que je propose :

Contrôle de qualité et trimming (FastQC, Trimmomatic)

Alignement des lectures avec reconnaissance des épissages (HISAT2)

Quantification des gènes (featureCounts)

Analyse d'expression différentielle (DESeq2 en R)

Visualisations haute résolution (volcano plots, heatmaps groupés, PCA)

Analyse d'enrichissement fonctionnel (analyse de voies GO et KEGG)


Ce que vous recevrez :

1. Jeux de données nettoyés et tableaux Excel annotés des DEG avec changements de pli et p-values ajustées.

2. Graphiques vectoriels/PNG haute résolution (300+ DPI) prêts pour publication.

3. Scripts R reproductibles et bien commentés.

4. Rapport analytique PDF résumé.


Veuillez me contacter avant de passer commande pour discuter de la taille de votre jeu de données et de vos besoins en projet !

Langage de programmation:

Python

•

R

•

SPSS

•

SQL

•

NoSQL

Technologie:

Excel

•

Google Analytics

•

Google Data Studio

Type d'analyse:

Analyse quantitative

•

analyse statistique

Expertise:

Conception expérimentale

•

Algorithmes

•

Prédiction

Outils:

Minitab

•

RStudio

•

Stata

•

Google Colab

•

Microsoft Excel

Mon portfolio

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