Je réaliserai une analyse bulk rnaseq avec expression différentielle des gènes, go, analyse de voie

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Anasmunir

Italie

Je parle Anglais, Italien

Consultant en sciences

Doctorat en bioingénierie. Spécialisation en biologie moléculaire à l’université, expérience avec les nanoparticules, puis culture tissulaire et organes sur puce. Actuellement chercheur en oncologie d...
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À propos de ce service

Vous avez des données RNA-seq et vous avez besoin de résultats clairs et défendables ?

Je vais exécuter un pipeline RNA-seq en R/Python entièrement reproductible et fournir des figures prêtes à publication avec un rapport d’interprétation d’expert pour que vous puissiez passer directement de données brutes à la prochaine section de votre manuscrit.

  • Contrôle de qualité et vérification du design : revue des métadonnées, validation des réplicats, détection des valeurs aberrantes et PCA
  • Analyse de l’expression différentielle : DESeq2 ou edgeR avec correction FDR (BenjaminiHochberg)
  • Figures prêtes à publication : volcano, MA, PCA, heatmap en clusters, diagrammes en points/bulles de voies
  • Enrichissement fonctionnel : GO (BP/MF/CC) ± KEGG/Reactome via g:Profiler ou clusterProfiler
  • Tableaux de données organisées : comptes normalisés, valeurs stabilisées par la variance, et tableaux DEG (CSV/XLSX)
  • Rapport détaillé : HTML ou PDF avec méthodes complètes, paramètres et interprétation en langage simple


Ce dont j’ai besoin de votre part :

Option A : fichiers FASTQ + fiche d’échantillon

Option B : matrice de comptage brute (gènes × échantillons) + fiche d’échantillon

Humain, souris, rat ou autre, faites-le moi savoir.


Veuillez noter :

Les résultats sont uniquement à des fins de recherche, aucune affirmation clinique ou diagnostique n’est faite. Toutes les données sont traitées de manière confidentielle et ne sont pas partagées avec des tiers.

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do bulk rnaseq analysis with differential gene expression, go, pathway analysis
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Technologie:

Jupyter Notebook

•

RStudio

Type d'analyse:

Analyse quantitative

•

Analyse qualitative

+2

Expertise:

Autres

Langage de programmation:

Python

•

R

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