Je vais analyser les données ngs fastq avec fastqc et fournir un rapport de contrôle qualité

Bienvenue sur mon service

Je vais analyser professionnellement vos données de séquençage NGS (fichiers FASTQ) et fournir un rapport de contrôle qualité clair et facile à comprendre en utilisant FastQC.

Ce service vous aide à déterminer si vos données de séquençage sont suffisamment bonnes pour une analyse en aval comme RNA-seq, détection de variants ou études du génome.

Que vais-je faire ?

• Qualité globale de la séquence
• Distribution des scores de qualité par séquence
• Analyse de la teneur en GC
• Niveaux de duplication des séquences
• Vérification de la contamination par adaptateurs
• Distribution de la longueur des lectures
• Identification des avertissements et modules échoués

Tous les résultats seront clairement expliqués, même si vous n’êtes pas bioinformaticien.

Outils que j’utilise

• FastQC
• Linux (environnement Ubuntu)
• Workflow professionnel basé en ligne de commande

Ce que vous recevrez

Vous obtiendrez :

• Rapport HTML FastQC
• Graphiques de qualité (comme le graphique de score de qualité par séquence)
• Explication simple de PASS / WARN / FAIL
• Recommandation claire (vos données sont-elles utilisables ou non ?)

Si nécessaire, je vous guiderai également sur les prochaines étapes (trim, filtrage ou analyse).

Types de données supportés

• RNA-seq
• DNA-seq
• WGS / WES
• Fichiers FASTQ Illumina
• Données single-end ou paired-end

Pourquoi me choisir

• Formation en bioinformatique
• Expérience réelle en recherche
• Rapports propres et honnêtes
• Livraison rapide