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Je réaliserai une analyse bioinformatique rna seq, docking de protéines, blast, msa
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Bioinformaticien
Je suis analyste en bioinformatique spécialisée dans l'analyse de séquences, de structures et de fonctions de protéines. J'utilise BLAST, MSA, AlphaFold, InterPro et STRING pour fournir des rapports p...
À propos de ce service
Vous avez besoin d’une analyse bioinformatique précise et reproductible en laquelle vous pouvez avoir confiance ?
Je propose des analyses bioinformatiques claires, prêtes à être publiées, couvrant le RNA-seq, l’analyse de séquences/protéines, et le docking moléculaire avec une documentation complète pour que vous compreniez exactement comment les résultats ont été générés.
Ce que je propose :
Analyse RNA-seq et expression différentielle des gènes (DGE, diagrammes en volcan, heatmaps)
Analyse de séquences de protéines (BLAST, recherche d’homologues)
Alignement multiple de séquences (MSA) et identification des régions conservées
Construction d’arbres phylogénétiques et analyse évolutive
Prédiction de la structure des protéines (AlphaFold, confiance pLDDT)
Annotation de domaines et de motifs (InterPro, Pfam, SMART)
Réseaux d’interactions protéine-protéine (STRING)
Docking moléculaire et analyse des sites de liaison (AutoDock Vina)
Rapport prêt pour le client avec figures, code et interprétation
Avec qui je travaille : chercheurs, étudiants et startups biotech ayant besoin d’analyses propres et documentées pour des articles, thèses ou rapports, pas seulement des résultats bruts.
Livrables : code reproductible (Python/R), figures de qualité publication, interprétation écrite des résultats.
Note : contactez-moi d’abord avec votre dataset/protéine/question pour que je puisse confirmer la portée avant de passer commande.
Technologie:
Jupyter Notebook
•
Pandas
•
RStudio
•
Autres
Expertise:
Prédiction
Langage de programmation:
Python
•
R
Mon portfolio
FAQ
Traduction automatique
De quelles données/fichiers avez-vous besoin de ma part pour commencer ?
Pour RNA-seq : fichiers FASTQ bruts ou un numéro d'accession GEO/SRA. Pour l'analyse de protéines : une séquence de protéine (FASTA) ou un ID UniProt/PDB. Pour le docking : la structure de votre ligand (SMILES ou SDF) et la protéine cible. Si vous n'êtes pas sûr de ce que vous avez, envoyez-moi un message et je vous guiderai.
Fournissez-vous le code avec les résultats ?
R : Oui — chaque package inclut un code Python/R propre et commenté, ainsi que les figures et le rapport, pour que vous puissiez reproduire ou modifier l’analyse vous-même.
Puis-je utiliser ces résultats dans ma thèse ou dans un article publié ?
Oui, toutes les analyses sont réalisées avec des outils et des méthodes standard, évalués par des pairs, et les résultats vous appartiennent pour une utilisation libre dans vos travaux académiques.
Je ne suis pas sûr du package dont j'ai besoin — pouvons-nous en discuter d'abord ?
Bien sûr — envoyez-moi un message avec votre dataset ou votre question de recherche avant de passer commande, et je vous recommanderai le package adapté ainsi que le délai de livraison.
Proposez-vous des révisions si j’ai besoin de modifications à l’analyse ?
Le forfait Premium comprend une révision. Pour Basic/Standard, des clarifications mineures sont incluses — pour des modifications supplémentaires de l’étendue de l’analyse, nous pouvons discuter d’un devis personnalisé.
