Je réaliserai une bioinformatique et une analyse de médicaments

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Je parle Arabe, Anglais, Ourdou, Espagnol

Spécialiste en bioinformatique et data science en NGS, GROMACS et conception de médicaments

Bonjour, je suis Umair ! Biologiste computationnel expérimenté, data scientist et biotechnologue avec 1 année d’expérience combinée hors ligne et en ligne, je transforme des données biologiques comple...
À propos de ce service

Vous cherchez un biologiste computationnel expert pour accélérer vos recherches en découverte de médicaments, thérapeutiques ou transcriptomique ? Vous êtes au bon endroit !


Je propose des services complets de bioinformatique, conception de médicaments computationnelle, conception de vaccins à énambé multi-épitope et analyse de données RNA-Seq, adaptés aux chercheurs, aux universitaires et aux projets biotech.


--- Ce que je propose ---


1. Découverte et criblage de médicaments computationnels

- Identification des cibles et préparation des protéines

- Criblage virtuel à haut débit (HTVS)

- Docking moléculaire (AutoDock Vina, Glide, Discovery Studio)

- Profilage ADMET, toxicité et similarité médicamenteuse (règles de Lipinski)

- Préparation et analyse des trajectoires de simulations dynamiques moléculaires (MD)


2. Immuno-informatique et conception de vaccins

- Conception de vaccins peptidiques multi-épitope contre des agents viraux, bactériens ou fongiques

- Prédiction des épitopes B et T (MHC-I & MHC-II) et analyse de la conservation

- Profiling d’allergénicité, de toxicité, d’antigénicité et de propriétés physico-chimiques

- Docking moléculaire du vaccin avec des récepteurs immunitaires (TLRs)


3. Pipeline RNA-Seq et transcriptomique

- Contrôle qualité (FastQC) et trim des lectures (Trimmomatic/Fastp)

- Alignement sur le génome de référence

Domaine:

Machine learning

•

Vision par ordinateur

•

Deep learning

Expertise:

Apprentissage des fonctionnalités

Langage de programmation:

Python

•

R

Outils:

opencv

•

Amazon SageMaker

•

Deep Dream Generator

•

CVAT

Technologie:

Python

•

R

•

SPSS

•

Stata

•

Excel

•

RStudio

Modélisation et méthodes:

Machine learning

•

Deep learning