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Je ferai de l'interaction de docking moléculaire, gnina, autodock vina et pymol
Chimiste docteur, expert en chimiformatique et analytique
Chimiste titulaire d’un doctorat avec plus de 15 ans d’expérience en recherche et en enseignement. Je me spécialise dans la liaison entre les données expérimentales de laboratoire et les workflows com...
À propos de ce service
Vous avez besoin d’un docking moléculaire précis, prêt pour publication, pour votre recherche ou projet de conception de médicaments ? Je propose des services de chimie computationnelle utilisant AutoDock Vina et GNINA (évaluation par CNN en apprentissage profond), accompagnés d’un profilage détaillé des interactions.
Ce que je propose :
- Préparation de la cible et du ligand : réparation de la structure, attribution des charges, protonation à pH physiologique, et minimisation de l’énergie.
- Docking moléculaire : optimisation de la boîte de grille (docking ciblé ou à l’aveugle) avec AutoDock Vina et GNINA pour des prédictions d’affinité fiables (kcal/mol).
- Profilage des interactions : cartes 2D haute résolution via BIOVIA Discovery Studio (liaisons hydrogène, pi-stacking, ponts salins) et visualisations 3D ray-tracées dans PyMOL.
Livrables :
- Fichiers de complexes dockés (.pdb, .pdbqt, .sdf)
- Séance PyMOL entièrement modifiable (.pse)
- Figures prêtes pour publication en haute résolution 300+ DPI
- Tableau récapitulatif des énergies de liaison et contacts clés des résidus
Pourquoi me choisir ?
- Flux de travail rigoureux selon les standards de revue par les pairs
- Expertise approfondie en conception de médicaments assistée par ordinateur (CADD)
- Délais rapides et support scientifique clair
Veuillez m’envoyer un message avec votre PDB ID cible et les structures de ligand avant de commander !
Technologie:
Excel
•
Jupyter Notebook
•
MATLAB
Expertise:
Statistiques
Langage de programmation:
Python
•
R
•
SPSS
Outils:
Stata
•
Google Colab
•
Microsoft Excel

