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J'analyserai vos données de séquençage RNA à cellule unique et fournirai des insights personnalisés
Bioinformaticien et chercheur prédoctoral avec plus de 4 ans d’expérience dans l’analyse de données omiques, y compris la génomique, la transcriptomique, l’épigénomique et la protéomique. Je fournis d...
À propos de ce service
Je propose une analyse personnalisée de RNA-seq à cellule unique adaptée à votre jeu de données et à vos objectifs de recherche. Chaque projet est ajusté à la question biologique, en utilisant des workflows reproductibles en R ou Python (Seurat, Scanpy, etc.) pour fournir des résultats de haute qualité et interprétables.
Les services incluent :
- Contrôle de qualité et filtrage
- Normalisation, mise à l’échelle et réduction de dimension (PCA, UMAP/t-SNE)
- Clustering et identification de gènes marqueurs
- Annotation de type cellulaire et enrichment de voies en option
- Génération de visualisations prêtes à publier et de rapports synthétiques
Avec plus de quatre ans d’expérience en bioinformatique et dans plusieurs disciplines omiques, je m’assure que chaque analyse soit robuste, transparente et biologiquement significative. Veuillez me contacter avant de commander pour discuter de vos données et de vos objectifs d’analyse.
FAQ
Traduction automatique
Quel type de données puis-je fournir ?
Vous pouvez fournir soit des fichiers FASTQ bruts (pour traitement avec Cell Ranger ou équivalent) soit des matrices de comptage traitées (par exemple, .mtx, .h5 ou .csv). J’adapterai le workflow en fonction du type de données et de vos objectifs de projet.
Réalisez-vous le traitement des données brutes (FASTQ vers matrice de comptage) ?
Oui. Cette étape peut être ajoutée en tant que service supplémentaire et inclut l’alignement des lectures, le comptage des UMI, et la génération de la matrice d’expression adaptée à l’analyse en aval.
Quels outils utilisez-vous pour l’analyse ?
J’utilise principalement Seurat, Scanpy, Monocle3 et Cell Ranger, ainsi que des packages R et Python standards pour la visualisation et l’enrichissement.
Pouvez-vous intégrer plusieurs échantillons ou lots ?
Oui. La correction de lot et l’intégration multi-échantillons peuvent être incluses en option. J’utilise Seurat v4, Harmony ou Scanorama selon les caractéristiques du jeu de données.
Comment discutons-nous de la question biologique ou du plan d’analyse ?
Avant de commencer, nous échangerons quelques messages pour définir vos principaux objectifs et les détails de vos données. Je confirmerai ensuite le meilleur package ou proposerai une offre personnalisée si nécessaire.
Pouvez-vous aider à interpréter les résultats biologiquement ?
Oui. L’interprétation est incluse dans les packages Standard et Premium. Je mettrai en évidence les clusters, gènes marqueurs et voies les plus pertinents selon votre contexte expérimental.
Les analyses sont-elles confidentielles ?
Absolument. Toutes les données et résultats sont traités comme strictement confidentiels et utilisés exclusivement pour votre projet. Je peux signer un NDA sur demande.
Avis
2 avis concernant ce service
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Détails de la notation
- Niveau de communication avec le freelance
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Les plus pertinents
M 
mrdanielvm
Client récurrent
Espagne
Second project with Daniel, and again an excellent experience. I highly recommend his bioinformatics expertise. .
50 $US-100 $US
Prix
5 jours
Durée
Utile?M mrdanielvm
Client récurrent
Espagne
Amazing work on RNA technologies. The results were clear, well organized and delivered on time. The results exceeded my expectations. I would definitely recommend his services.
50 $US-100 $US
Prix
4 jours
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