J'analyserai vos données de séquençage RNA à cellule unique et fournirai des insights personnalisés

Vous pouvez fournir soit des fichiers FASTQ bruts (pour traitement avec Cell Ranger ou équivalent) soit des matrices de comptage traitées (par exemple, .mtx, .h5 ou .csv). J’adapterai le workflow en fonction du type de données et de vos objectifs de projet.

Oui. Cette étape peut être ajoutée en tant que service supplémentaire et inclut l’alignement des lectures, le comptage des UMI, et la génération de la matrice d’expression adaptée à l’analyse en aval.

J’utilise principalement Seurat, Scanpy, Monocle3 et Cell Ranger, ainsi que des packages R et Python standards pour la visualisation et l’enrichissement.

Oui. La correction de lot et l’intégration multi-échantillons peuvent être incluses en option. J’utilise Seurat v4, Harmony ou Scanorama selon les caractéristiques du jeu de données.

Avant de commencer, nous échangerons quelques messages pour définir vos principaux objectifs et les détails de vos données. Je confirmerai ensuite le meilleur package ou proposerai une offre personnalisée si nécessaire.

Oui. L’interprétation est incluse dans les packages Standard et Premium. Je mettrai en évidence les clusters, gènes marqueurs et voies les plus pertinents selon votre contexte expérimental.

Absolument. Toutes les données et résultats sont traités comme strictement confidentiels et utilisés exclusivement pour votre projet. Je peux signer un NDA sur demande.