Je vais effectuer une analyse différentielle de l'expression génique par séquençage RNA

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Bioinformatique, Biologie Moléculaire, Analyste de données

La biologie génère les données. Je vous aide à les rendre claires. Je travaille avec des jeux de données biologiques et de recherche, transformant des résultats bruts en fichiers propres, graphiques ...
À propos de ce service

Vous avez du mal avec vos données RNA-Seq et ne savez pas par où commencer ? Je réaliserai une analyse complète de l’expression génique différentielle (DGE) depuis les comptes bruts jusqu’aux insights biologiques.

Ce que je ferai :

  • Contrôle de qualité (FastQC, MultiQC)
  • Alignement des lectures (HISAT2/STAR)
  • Quantification des gènes (featureCounts/HTSeq)
  • Expression différentielle avec DESeq2 / edgeR
  • Graphiques volcano, heatmaps, PCA
  • Analyse d’enrichissement des voies GO & KEGG
  • Rapport final avec interprétation


Langage de programmation:

Python

R

Technologie:

Autres

Type d'analyse:

Analyse quantitative

analyse statistique

Expertise:

Statistiques

Outils:

Autres

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