Je vais effectuer une analyse de données scrnaseq

Je réaliserai une analyse de données single-cell RNA-seq (scRNA-seq) de haute qualité en utilisant des packages R tels que Seurat, SingleR, SingleCellSignalR et AUCell pour vous aider à découvrir des insights significatifs à partir de votre jeu de données.

Que vous soyez étudiant, chercheur ou membre d’un laboratoire biotech, je propose un flux de travail d’analyse fiable, reproductible et prêt à publication, accompagné de l’interprétation des résultats.

Mon analyse comprend :

• Contrôle de qualité (QC) et filtrage des cellules et des gènes
• Normalisation, mise à l’échelle et intégration des données (si nécessaire)
• Réduction de dimension (PCA, UMAP/t-SNE)
• Regroupement des cellules et identification des gènes marqueurs
• Analyse de l’expression différentielle entre clusters ou conditions
• Enrichissement fonctionnel (GO/KEGG) des gènes marqueurs
• Graphiques prêts à publication (UMAP/t-SNE, heatmaps, plots de caractéristiques)
• Résumé clair et scripts Seurat reproductibles.

Je peux travailler avec des matrices de comptage brutes ou des données traitées.

Si vous avez des exigences spécifiques, des conditions expérimentales ou un génome de référence préféré, veuillez me contacter avant de commander.

Les livrables sont adaptés à la taille de votre dataset et à vos objectifs de recherche, garantissant que vos résultats scRNA-seq sont prêts pour des présentations, une thèse ou une publication.