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J'analyserai des données de séquençage RNA en vrac et en cellule unique
Dongyao Zhang
À propos de ce service
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Vous cherchez un expert en bioinformatique qui comprend réellement la signification médicale et biologique derrière le code ?
Je suis un médecin clinicien et chercheur en oncologie spécialisé en transcriptomique. Je fais le lien entre les données brutes et des insights biologiques prêts à être publiés, en veillant à ce que vos résultats soient non seulement statistiquement significatifs, mais aussi biologiquement pertinents.
Mes services incluent :
- Analyse de RNA-seq en vrac : Contrôle qualité, analyse de l'expression différentielle (DESeq2/edgeR), enrichissement de voies (GO/KEGG/GSEA), et analyse de survie.
- RNA-seq en cellule unique (scRNA-seq) : Regroupement cellulaire et réduction de dimension (UMAP/t-SNE), annotation des types cellulaires, inférence de trajectoire, et communication entre cellules.
- Visualisation de données & graphiques : Figures de haute qualité prêtes à être publiées (heatmaps, diagrammes en volcan, diagrammes en violon, mises en page multi-panel) et créations de posters scientifiques personnalisés.
Pourquoi me choisir ?
- Double formation : J'interprète les données avec une perspective clinique, ce qui vous fait gagner du temps en expliquant la biologie de base.
- Maîtrise de R & Python : Scripts reproductibles et adaptés utilisant Jupyter ou RStudio.
Veuillez MESSAGER AVANT de commander pour discuter des spécificités de votre projet et du format de vos données !
Découvrez Dongyao Zhang
Dongyao Zhang
As a clinical MD and active oncology researcher, my dual background bridges th
- DeChine
- Membre depuisavr. 2026
- Temps de réponse moy.1 heure
Langues
Chinois, Anglais
Hi! As a clinical M.D. and active oncology researcher, my dual background bridges the gap between clinical insights and computational biology. I don't just run pipelines; I interpret the biological and metabolic story behind your data. I specialize in Bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq analysis using R and Python. Whether you need robust statistical models, custom scripts, or publication-ready visualizations like ROC curves, I deliver rigorous results to elevate your impactful research.
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FAQ
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Quel type de format de données avez-vous besoin pour commencer l’analyse ?
Je commence généralement avec des matrices de comptage (.csv/.txt), des fichiers h5 ou des objets Seurat/Scanpy. Si vous n’avez que des fichiers FASTQ bruts, veuillez me contacter d’abord, car l’alignement brut nécessite une offre personnalisée.
Fournissez-vous le code source (scripts R ou Python) avec les résultats ?
Absolument ! La reproductibilité est une priorité pour moi. Je fournirai des scripts R propres et commentés ou des notebooks Jupyter Python avec vos figures haute résolution et tableaux de données finalisés.
Pouvez-vous aider à interpréter la signification biologique des résultats de l’analyse ?
Oui ! En tant que médecin clinicien et chercheur en oncologie, je ne me contente pas d’exécuter des modèles statistiques. Je peux aider à interpréter les enrichissements de voies, les interactions entre cellules et leur pertinence clinique pour votre étude.
Les visualisations de données sont-elles prêtes pour une publication dans une revue ?
Oui. Je fournis des figures haute résolution (PDF/TIFF) comme des UMAP et des heatmaps. Avec mon expérience en conception de posters scientifiques et graphiques, je peux aussi personnaliser les couleurs et les mises en page multi-panel pour votre revue cible.
