J'analyserai vos données bulk rnaseq avec des figures prêtes pour publication

Vous avez du mal avec l’analyse RNA-seq ? Je transformerai vos données de séquençage brutes en résultats de qualité publication.

CE QUE VOUS OBTENEZ :

Rapports de contrôle qualité (FastQC, MultiQC)

Analyse de l’expression différentielle (DESeq2 ou edgeR)

Diagramme volcano montrant les gènes régulés à la hausse ou à la baisse

Diagramme PCA avec regroupement des échantillons

Heatmap des gènes différentiellement exprimés principaux

Analyse d’enrichissement de voies GO/KEGG

Fichiers CSV avec toutes les statistiques et listes de gènes

Section méthodes écrite (prête pour votre article)

CE QUE J’AI BESOIN DE VOUS :

- Fichiers FASTQ (ou numéros d’accès SRA)

- Informations sur les échantillons (quels échantillons sont contrôle vs traitement)

- Nom de l’organisme (je peux travailler avec n’importe quelle espèce ayant un transcriptome)

J’utilise des outils standards de l’industrie : Salmon/STAR pour l’alignement, DESeq2/edgeR pour les statistiques, clusterProfiler pour l’analyse de voies. Toute l’analyse est entièrement reproductible avec un code documenté.

EXPÉRIENCE : RNA-seq multi-tissus (cerveau, foie, rein, testicules, graisse) expériences en série temporelle (réponse à la photopériode) données à faible comptage et transcripts rares appel de variants cliniques à partir de RNA-seq organismes non-modèles sans annotation.

Des questions ? Contactez-moi avant de commander. Je suis heureux de discuter de vos besoins spécifiques et de recommander le bon service !