Je vais analyser les données de microbiome et de métagénomique 16s shotgun en r et python

Libérez la puissance des insights microbiens avec une analyse experte en métagénomique

Bienvenue ! Je suis un chercheur bioinformaticien formé avec une expérience pratique en métagénomique avancée, profilage du microbiome et analyse de données génomiques. Je me spécialise dans l’extraction d’informations approfondies à partir de données de séquençage complexes, qu’il s’agisse de projets 16S, ITS, 18S rRNA ou métagénomique shotgun.

Mes solutions en bioinformatique sont idéales pour :

• Les chercheurs académiques
• Les entreprises de biotechnologie
• Les études environnementales sur le microbiome
• Les projets sur le microbiome humain/animal

Services que je propose :

• Prétraitement des données brutes : trimming, filtrage, décontamination (FastQC, Trimmomatic, BBMap)
• Assemblage et annotation du métagénome (MEGAHIT, SPAdes, Prokka, EggNOG)
• Profilage taxonomique (Kraken2, Bracken, QIIME2)
• Analyse fonctionnelle (HUMAnN3, LEfSe, PICRUSt2)
• Métriques de diversité (Alpha, Beta ; PCoA, NMDS)
• Découverte de biomarqueurs et analyse de l’abondance différentielle
• Visualisations personnalisées (R, Python, ggplot2, Krona, heatmaps)
• Rapports scientifiques détaillés avec interprétation

Technologies et outils : QIIME2, HUMAnN, Kraken2, Bowtie2, MEGAHIT, LEfSe, R, Python, Linux, Galaxy, BBMap, EggNOG, Prokka

Décodons vos données et transformons les séquences en science.