Je ferai des simulations de dynamique moléculaire en utilisant gromacs

Les simulations de dynamique moléculaire sont couramment utilisées pour valider numériquement la stabilité des protéines et des interactions protéine-ligand.

Veuillez me consulter avant de passer commande.

Je réaliserai des simulations de dynamique moléculaire de votre protéine ou de vos systèmes protéine-ligand en milieu aqueux.

J’utilise Gromacs pour les simulations.

Gromacs est une application open-source très citée dans la littérature.

Je peux générer des données essentielles telles que RMSD (écart-type quadratique moyen), RMSF (fluctuation quadratique moyenne), rayon de giration et calculs d’énergie libre. En plus des outils Gromacs, j’utilise VMD, Pymol et Discovery Studio pour l’analyse et la visualisation.

Je peux préparer des figures en haute résolution pour des publications.

Je peux également rédiger la section méthodes et résultats pour vous.