Je vais fournir une formation en direct sur Zoom concernant la simulation de dynamique moléculaire

Souhaitez-vous apprendre la simulation de dynamique moléculaire (MD) à travers des sessions de formation claires, pratiques et en direct via Zoom ?

Je propose un accompagnement étape par étape adapté aux débutants, étudiants et chercheurs qui souhaitent maîtriser les workflows MD avec GROMACS.

Forfaits

Basique : Simulation de protéines en MD

Apprenez le workflow complet pour simuler une protéine dans l’eau.

Workflow complet GROMACS

Configuration du système : protéine dans l’eau, dimensions de la boîte jusqu’à 10 × 10 × 10 nm

Outils d’analyse essentiels :

RMSD, RMSF, rayon de giration (Rg), liaisons hydrogène

Standard : Simulation de complexe protéine-ligand en MD

Inclut tout ce qui est dans le forfait Basique, plus :

Préparer et simuler un complexe protéine-ligand dans l’eau

Workflow de génération de topologie du ligand

Analyses supplémentaires pertinentes pour les études de liaison

Premium : Simulation avancée en MD

Inclut tout ce qui est dans le Standard, plus :

Simulation de protéines membranaires (construction de membrane + insertion)

Options d’analyse supplémentaires, telles que :

Distance, SASA, clustering, MSD, contacts, graphiques personnalisés, etc.

Convient pour des projets complexes, de niveau publication

Informations importantes

Veuillez partager votre fichier PDB de la protéine ou l’ID PDB avant la session.

Tarification personnalisée applicable pour des protéines très volumineuses ou multimeriques ou pour des analyses complexes.