Je vais faire de l'analyse de données en bioinformatique avec python et r

Je suis bioinformaticien et développeur Python/R avec plus de 5 ans d'expérience dans le traitement de jeux de données NGS et le développement de workflows analytiques. Co-auteur de 15 publications évaluées par des pairs (Genome Medicine, Epigenetics & Chromatin).

Services :

• Analyse de données NGS : WGS/WES (GATK, priorisation de SNP, détection de variants), RNA-seq (DESeq2), ChIP-seq (ChIPseeker), et Hi-C/Exo-C (Juicer, Juicebox).
• Scripting en bioinformatique : Scripts personnalisés et développement de pipelines en Python (Pandas, NumPy, scikit-learn) et R (Bioconductor).
• Outils & environnements : BLAST, BWA, Bowtie2, SAMtools, Picard, Docker, Conda, Bash.
• Visualisation de données : Figures prêtes pour publication avec Matplotlib, Seaborn, Plotly et ggplot2.

Livrables :

• Données de séquences traitées et fichiers de variants (VCF, BAM, BED, matrices de comptage).
• Code propre, documenté et environnements reproductibles.
• Rapports synthétiques avec figures et interprétations de données.

Veuillez me contacter avant de passer commande pour discuter de la structure de vos données et des exigences de votre projet.