Je réaliserai des simulations MD de protéines modifiées et de complexes ligand
Professeur associé de chimie physique
À propos de ce service
Je propose des simulations de dynamique moléculaire (MD) professionnelles utilisant Schrödinger Maestro (Desmond) pour les protéines, complexes protéine-ligand, et protéines modifiées covalentes. Mes services incluent la préparation du système, la configuration de la simulation, les runs MD de production, et une analyse complète des trajectoires (RMSD, RMSF, rayon de giration, SASA, liaisons hydrogène, structure secondaire, et plus). Vous recevrez des figures de qualité publication, des fichiers de simulation, et un rapport scientifique clair pour soutenir votre recherche ou développement de produit.
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FAQ
Traduction automatique
De quelles informations avez-vous besoin pour démarrer le projet ?
J’ai généralement besoin de la structure de la protéine (fichier PDB ou ID PDB), la structure du ligand (si applicable), les détails de toute modification covalente ou mutation, vos objectifs de recherche, et la durée souhaitée de la simulation. Si vous n’êtes pas sûr, je peux vous aider à déterminer la meilleure configuration.
Pouvez-vous simuler des protéines chimiquement modifiées ou des complexes covalents protéine–ligand ?
Oui. Je peux modéliser des protéines modifiées covalentes.
Que vais-je recevoir à la fin du projet ?
Vous recevrez les fichiers d’entrée et de sortie de la simulation, les fichiers de trajectoire, des graphiques d’analyse de qualité publication (tels que RMSD, RMSF, Rg, SASA, et structure secondaire), ainsi qu’un rapport concis expliquant les résultats et comparant la stabilité structurale de vos systèmes.
