Je vais analyser les données RNA seq en utilisant deseq2, edger, go, kegg et pca

Vous cherchez une analyse RNA-seq rigoureuse, prête à être publiée, et pas un script qui sort simplement un CSV ?

Je suis le Dr Faisal, biologiste moléculaire végétal avec un doctorat et chercheur postdoctoral (Connecticut Agricultural Experiment Station, États-Unis) avec plus de 35 publications évaluées par des pairs et une expérience pratique en RNA-seq sur plus de 20 espèces.

CE QUE VOUS OBTENEZ :

QC (FastQC/MultiQC)

Trimming et alignement (HISAT2/STAR ou kallisto/salmon)

Expression différentielle (DESeq2/edgeR)

PCA, diagrammes en volcano, heatmaps

Analyse d’enrichissement GO et de voies KEGG

Interprétation biologique écrite

POUR QUI CECI EST-IL :

Étudiants en master, postdoctorants et laboratoires avec des données brutes FASTQ ou de comptage qui ont besoin d’une analyse correcte, prête à publier, et pas seulement de chiffres.

CE QUE JE VOUS DEMANDE :

Fichiers FASTQ, matrice de comptage ou accès SRA

Conception expérimentale (quels échantillons appartiennent à quel groupe)

Génome de référence / espèce

Contactez-moi avant de commander si votre jeu de données est volumineux ou provient d’une espèce non modèle, afin que je puisse vous faire un devis précis.