Je vais analyser les données de séquençage d'ARN à cellule unique avec R et Seurat

Travaillez-vous avec des données de séquençage d'ARN à cellule unique et avez-vous besoin d’aide pour votre workflow Seurat ?

Je propose une analyse claire et reproductible du RNA-seq à cellule unique en utilisant R et Seurat. Selon le package choisi, je peux vous aider avec :

Contrôle de qualité et filtrage des cellules

Normalisation et sélection de caractéristiques variables

PCA, UMAP, clustering et évaluation des effets de lot

Analyse des gènes marqueurs et expression différentielle

Annotation de type cellulaire de base en utilisant des marqueurs connus

Graphiques UMAP, violon, caractéristiques, points et heatmaps prêts pour publication

Dépannage des objets Seurat, des assays, des couches et des erreurs d’analyse

Vous recevrez un code R organisé, des résultats d’analyse, des figures et une explication claire du workflow. Je me concentre sur une analyse précise, une communication transparente et des résultats compréhensibles et reproductibles.

Veuillez noter : vous devez fournir une matrice de comptage, une matrice d’expression traitée ou un objet Seurat. Le traitement brut FASTQ n’est pas inclus. L’annotation cellulaire est basée sur les marqueurs disponibles et les informations de référence, et doit être validée biologiquement.

Contactez-moi avant de commander pour discuter de la taille de vos données, de votre question de recherche, des livrables attendus et du calendrier.