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Je vais télécharger et aligner vos échantillons fastq sur le génome
En tant que chercheur en doctorat au Centre national de recherche contre le cancer, ma spécialisation consiste à fournir des analyses bioinformatiques avancées, notamment dans des domaines clés tels q...
Niveau 1
Répond à certains critères de performance et présente un fort potentiel sur la place de marché.
À propos de ce service
Les données de microarray ou RNAseq publiques sont très utiles pour différentes analyses. Ces fichiers sont très volumineux, et une infrastructure informatique puissante est nécessaire pour les obtenir. En utilisant un HPC Linux, je téléchargerai toutes vos données (échantillons fastq) depuis des bases de données publiques telles que SRA, ENA, NIH, etc. Je les alignerai sur le génome (humain, souris, poisson zèbre...) en utilisant STAR ou Salmon, et je vous fournirai les comptes bruts avec lesquels vous pourrez réaliser des analyses en aval.
De plus, je vous fournirai un rapport html avec les métriques, statistiques et étapes de contrôle qualité des échantillons alignés.
Chaque échantillon coûtera 5 $
Si vous avez des questions, écrivez-moi et nous en parlerons !
Technologie:
Python
•
RStudio
•
Autres
Type d'information:
Listes
•
Autres
Technique:
Manuel
