Je réaliserai des analyses d'amarrage moléculaire et d'interaction protéine-ligand

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Bioinformaticien et biologiste computationnel

Je suis bioinformaticien et biologiste computationnel avec une expérience pratique dans le développement de pipelines NGS, l’annotation de variants somatiques, et l’apprentissage automatique appliqué ...
À propos de ce service

Vous recherchez des services précis de docking moléculaire et de découverte de médicaments par calcul pour votre recherche ou publication ? Je propose un criblage virtuel basé sur la structure, des calculs d’affinité de liaison, et un profilage des interactions en 2D/3D.


Services proposés dans cette offre :

  • Préparation de la cible : nettoyage du PDB, suppression de l’eau/des hétéroatomes, et attribution de l’état de protonation.
  • Préparation du ligand : optimisation de la structure, génération de conformations 3D, et minimisation de l’énergie.
  • Docking moléculaire : optimisation de la grille et calcul de la pose de liaison avec AutoDock Vina.
  • Analyse des interactions : cartographie des interactions en haute résolution en 2D (LigPlot+) et 3D (PyMOL) montrant les liaisons H et contacts hydrophobes.
  • Propriétés de type médicament : évaluation ADME-Tox et règle des 5 de Lipinski avec SwissADME.


Pourquoi choisir mon service ?

  • Solide formation en bioinformatique et biologie computationnelle
  • Figures prêtes à publication, haute résolution (300+ DPI)
  • Données brutes complètes fournies (.pdbqt, logs, poses de sortie)
  • Rapidité d’exécution et communication réactive


Veuillez m’envoyer votre PDB ID de la cible et vos structures de ligand (SMILES/SDF/PDB) pour discuter de votre projet avant de passer commande.