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Je fournirai des services de docking et de simulation md
DockVision
Level 2
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À propos de ce service
Traduction automatique
DockVision est plus qu’un service freelance classique. La plupart des vendeurs peuvent proposer des services en bioinformatique. La vraie différence réside dans la connaissance de la méthode à utiliser, la façon de concevoir correctement le workflow et la capacité de transformer une sortie brute de calcul en résultats scientifiquement significatifs. C’est là que mon expertise fait la différence.
Je suis un scientifique en calcul avec plus de 5 ans d’expérience pratique et plus de 100 projets réalisés pour des clients dans plus de 30 pays. Je gère des workflows de recherche complexes qui vont au-delà de la simple exécution de logiciels et de la livraison de résultats basiques.
Mes compétences incluent :
- Docking protéine-ligand
- Docking protéine-protéine
- Docking protéine-ADN/ARN
- Docking ion métallique
- Docking nanoparticules
- Docking peptides
- Simulations de membranes
- Simulations d’acides nucléiques
- Simulations de peptides/polymères
- Simulations MD à échantillonnage amélioré
Analyse post-simulation :
- MM/PBSA & MM/GBSA
- PCA/DCCM/FEL
- SASA & Rg
- Analyse des liaisons H
- Analyse de regroupement
- Analyse des interactions protéine-ligand
- Analyse de la structure secondaire
- Analyse de la carte de contact
- Analyse des distances et des angles
- Interaction des résidus
Mon objectif est de fournir une analyse scientifiquement fiable, reproductible, avec une interprétation claire, une visualisation de qualité publication et des résultats bien organisés.
Découvrez DockVision
DockVision
Computational Biologist and Data Scientist
Level 2
- DePakistan
- Membre depuisaoût 2022
- Temps de réponse moy.1 heure
- Dernière commandeenviron 23 heures
Langues
Anglais, Espagnol, Allemand, Français, Italien
A bio-technologist specializing in bioinformatics, computational biology, and in-silico drug discovery.
As founder of DockVision, I lead a consultancy delivering precision-engineered research solutions worldwide. With five years of excellence and 90+ projects across 30+ countries, our team executes end-to-end computational pipelines upholding the highest standards of scientific rigor and turning complex molecular challenges into publication-ready insight.
Traduction automatique
Mon portfolio
FAQ
Traduction automatique
Êtes-vous un bioinformaticien expert?
Oui, j'ai plus de 5 ans d'expérience professionnelle en bioinformatique, avec des projets réussis de docking moléculaire, de simulations de dynamique moléculaire et de recherche computationnelle avancée pour des clients internationaux.
Pouvez-vous prédire les cibles des médicaments ?
Oui, je travaille avec des données de séquence. En fonction des besoins du client, je peux prédire les candidats aux cibles médicamenteuses, et le dépistage virtuel des médicaments est également une option.
Le prix est-il le même pour toutes les tâches mentionnées dans service?
Non, ce n'est pas la même chose pour tous les projets, cela dépend du projet et de son ampleur.
De quelles informations avez-vous besoin pour démarrer le projet ?
J'ai besoin de la structure de la protéine (ID PDB ou fichier), de la structure du ligand/peptide, et d'objectifs clairs pour le projet.
Quel logiciel utilisez-vous ?
Je travaille avec AutoDock Vina, Schrödinger, MOE, HADDOCK, GROMACS, NAMD, ACEMD, Desmond, VMD, PyMOL, ChimeraX, CHARMM-GUI, AmberTools, PLUMED, Python, R, Bash/Linux, Claude Code, Cursor, Jupyter, ainsi que des bibliothèques Python telles que MDAnalysis, MDTraj, ProDy, Biopython, NumPy, Pandas, Matplotlib et SciPy.
Quelle est la durée des simulations MD que vous réalisez ?
Généralement entre 50 et 500 ns, selon les besoins du projet. Des simulations plus longues peuvent être organisées si nécessaire.
Pouvez-vous aider à l'interprétation des résultats ?
Oui, je fournis une interprétation scientifique claire pour vous aider à comprendre si votre complexe est stable et prometteur.
Votre travail est-il adapté à la publication ?
Oui, l'analyse et les rapports sont préparés selon les normes académiques et de recherche.
Quelles analyses sont incluses après la simulation MD ?
RMSD, RMSF, rayon de giration, analyse des liaisons hydrogène, SASA, stabilité des interactions, énergie de liaison libre (MM-PBSA/MM-GBSA), PCA, DCCM, FEL, analyse de cluster, et bien d'autres.
Pouvez-vous effectuer un criblage virtuel de grandes bibliothèques de composés ?
Oui, je peux analyser plusieurs composés et les classer en fonction de leur affinité de liaison et de la qualité de leurs interactions.
Avis
54 avis concernant ce service
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Détails de la notation
- Niveau de communication avec le freelance
- Qualité de la livraison
- Valeur de la livraison
Trier par
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M maalotaibi
Arabie Saoudite
Collaboration en coursThe order was delivered before the agreed time and the quality of work was good, I will do other service with him again
200 $US-400 $US
Prix
4 jours
Durée
Utile?J joy_hj
États-Unis
Collaboration en coursnice work N
200 $US-400 $US
Prix
5 jours
Durée
Utile?J joy_hj
États-Unis
Collaboration en coursgrt work and fast
50 $US-100 $US
Prix
2 jours
Durée
Utile?A aashamrani
Arabie Saoudite
Collaboration en coursoutstanding effort and truly excellent work.
400 $US-600 $US
Prix
9 jours
Durée
Utile?J just_som_motion
Italie
Collaboration en coursOttimo lavoro ed attenzione ai dettagli
50 $US-100 $US
Prix
2 jours
Durée
H 
Réponse du freelance
Utile?
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200 $US-400 $US
Prix
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Utile?J joy_hj
États-Unis
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200 $US-400 $US
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États-Unis
Collaboration en coursgrt work and fast
50 $US-100 $US
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Arabie Saoudite
Collaboration en coursoutstanding effort and truly excellent work.
400 $US-600 $US
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Durée
Utile?J just_som_motion
Italie
Collaboration en coursOttimo lavoro ed attenzione ai dettagli
50 $US-100 $US
Prix
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Durée
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Utile?
