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Je vais effectuer un docking moléculaire avec une analyse complète
Expert en découverte de médicaments par calcul, bioinformatique et sensibilisation académique
Je suis Mahedi Hassan, chercheur en biochimie et bioinformatique. Je me spécialise dans la conception de médicaments assistée par ordinateur (CADD) et la stratégie académique.
🔬 Recherche : Expert e...
À propos de ce service
Services d’expert en docking moléculaire et simulation MD
Améliorez votre recherche de découverte de médicaments avec une analyse bioinformatique de haute précision. Je propose des modélisations moléculaires professionnelles, du docking et des simulations de dynamique avec des résultats de qualité publication.
Ce que je propose :
- Docking moléculaire : Interaction précise entre protéines et ligands utilisant AutoDock Vina/Gold.
- Criblage virtuel : Criblage à haut débit et identification de hits à partir de grandes bibliothèques.
- Simulation MD : Dynamique moléculaire robuste jusqu’à 50 ns+ avec GROMACS/NAMD.
- Analyse complète : Graphiques de trajectoire (RMSD, RMSF, Rg), analyse des liaisons hydrogène.
Pourquoi choisir ce service ?
- Visuels de haute qualité : Diagrammes d’interaction 2D/3D professionnels.
- Scientifiquement précis : Insights basés sur des données, adaptés pour des revues à fort impact.
Livrables : Fichiers de données brutes, graphiques en haute résolution et rapport technique détaillé.
Veuillez m’envoyer un message avant de passer commande pour discuter de vos besoins spécifiques en protéines/ligands.
Mon portfolio
FAQ
Traduction automatique
Quels logiciels utilisez-vous pour le docking et les simulations ?
J’utilise principalement AutoDock Vina ou Gold pour le docking moléculaire et GROMACS pour des simulations de dynamique moléculaire (MD) performantes. Pour la visualisation et l’analyse, j’utilise PyMOL, ChimeraX et Discovery Studio.
Question : Quels fichiers dois-je fournir pour démarrer le projet ?
Réponse : Vous n’avez besoin de fournir que la structure de la protéine (ID PDB ou fichier) et la structure du ligand/médicament (SDF, SMILES ou PDB). Si vous n’êtes pas sûr des structures, n’hésitez pas à m’envoyer un message, je peux vous aider à les localiser.
Question : Pouvez-vous réaliser des simulations MD de plus de 100 ns ?
Réponse : Oui. Bien que mes packages standards offrent jusqu’à 100 ns, je peux réaliser des simulations plus longues (par exemple 200 ns, 500 ns ou 1 μs) selon vos besoins de recherche. Contactez-moi pour un devis personnalisé pour des durées prolongées.
