Je réaliserai des simulations MD avec LAMMPS et GROMACS pour des nanoparticules et la livraison de médicaments


À propos de ce service
Traduction automatique
Bienvenue chez Expert en nanotechnologie computationnelle & services MD !
Vous avez besoin de simulations de haute précision pour comprendre les interactions ligand-nanoparticule ? En tant que biochemiste professionnel spécialisé en conception de médicaments computationnelle, je propose des simulations de dynamique moléculaire (MD) et de docking de niveau recherche.
Je me spécialise dans :
- Nanomatériaux : nanoparticules d’or (AuNPs), nanotubes de carbone (CNTs), fullerènes, surfaces Si(100).
- Transport de médicaments : nanocarriers polymériques et complexes ligand-protéine-nanoparticule.
- Ciblage viral : MERS-CoV, MRSA, et conception de médicaments anticancéreux.
Ce que je propose :
- LAMMPS & GROMACS : simulations MD fiables (100ns à plus de 500ns).
- Docking moléculaire : identification précise de l’affinité de liaison et du site.
- Analyse approfondie : RMSD, RMSF, Rg, SASA, RDF, et nombre de coordination.
- Visuels prêts pour publication : figures 300 DPI (TIFF/PNG) et vidéos de trajectoire HD (OVITO/PyMOL).
Pourquoi me choisir ?
- Perspective de chercheur : je fournis des logs techniques (.log, .xvg) et des scripts d’entrée.
- Accélération GPU : délais rapides pour des systèmes complexes.
Veuillez me contacter avant de commander pour discuter de vos paramètres de simulation spécifiques !
Découvrez Azan
Computational Drug Discovery Expert, Bioinformatics and Academic Outreach
- DeBangladesh
- Membre depuisfévr. 2025
- Temps de réponse moy.1 heure
- Dernière commande2 semaines
Langues
Bengali, Anglais
Traduction automatique
Mon portfolio
FAQ
Traduction automatique
Q : Quel logiciel utilisez-vous pour les simulations ?
J’utilise principalement GROMACS pour les simulations de DM et AutoDock Vina pour le docking moléculaire, fonctionnant sous Linux/Ubuntu pour une efficacité maximale.
Quel type de nanoparticules pouvez-vous simuler ?
J’ai une vaste expérience avec les nanotubes de carbone (CNT), nanoparticules métalliques (or/argent) et nanocarriers lipidiques. Si vous avez un système personnalisé, n’hésitez pas à partager les fichiers .pdb ou .sdf.
Quels champs de force utilisez-vous ?
Je suis expérimenté avec CHARMM, AMBER, OPLS-AA et Tersoff (pour LAMMPS), en fonction des besoins du système.

