Je vais effectuer une simulation de dynamique moléculaire jusqu'à 100 ns d'un complexe protéine-ligand

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Expert en découverte de médicaments par calcul, bioinformatique et sensibilisation académique

Je suis Mahedi Hassan, chercheur en biochimie et bioinformatique. Je me spécialise dans la conception de médicaments assistée par ordinateur (CADD) et la stratégie académique. 🔬 Recherche : Expert e...
À propos de ce service

Vous cherchez un professionnel pour réaliser des simulations de dynamique moléculaire (MD) pour votre recherche ou projet ? Vous êtes au bon endroit.


Je suis biologiste computationnel / bioinformaticien avec une expertise dans la réalisation de simulations MD approfondies. Je réaliserai une simulation de dynamique moléculaire de 100 ns pour votre complexe protéine-ligand en utilisant des logiciels standards de l’industrie.


Mes services incluent :


  • Préparation du système (solvatation, ionisation, minimisation d’énergie)
  • Équilibrage du système (NVT et NPT)
  • Exécution de la phase de production (simulation MD de 100 ns)
  • Analyse de trajectoire (RMSD, RMSF, liaisons hydrogène, etc. - disponible dans le package Premium)


Logiciels que j’utilise :


  • GROMACS
  • VMD / PyMOL / Chimera


Pourquoi me choisir ?


  • Fichiers de trajectoire de haute qualité.
  • Analyse détaillée et visualisation.
  • Livraison dans les délais.
  • Satisfaction garantie à 100 %.


Ce dont j’ai besoin de votre part :


  • ID PDB de la protéine ou fichier de structure de la protéine.
  • Fichier ligand (PDB/MOL2) ou chaîne SMILES.


Note : Veuillez me contacter avant de passer commande afin que nous puissions discuter de vos besoins spécifiques pour le projet.

Mon portfolio