Je vais exécuter une simulation de dynamique moléculaire et analyse

« Besoin d'une simulation de dynamique moléculaire (MD) fiable pour votre protéine ou complexe protéine-ligand ? Je propose des simulations MD de qualité recherche avec GROMACS, aidant chercheurs et étudiants à valider la stabilité structurale et le comportement de liaison dans le temps. »

Ce que j'offre : simulations MD de protéines ou complexes protéine-ligand avec configuration du système, minimisation de l'énergie, equilibration et simulations de production. L'analyse post-simulation comprend RMSD, RMSF, rayon de giration, analyse des liaisons hydrogène, et calculs optionnels de l'énergie libre de liaison MM-PBSA/GBSA.

Outils : GROMACS, VMD, PyMOL, Xmgrace pour les graphiques.

Vous recevrez : un rapport PDF détaillé avec tous les graphiques d'analyse, fichiers de trajectoire/bruts, et un résumé clair des résultats sur la stabilité structurale.

Pourquoi me choisir : expérience pratique sur l'ensemble du processus informatique, du docking à la MD en passant par l'analyse de l'énergie libre, ce qui me permet de comprendre comment vos résultats de simulation s'intègrent dans le contexte global de votre projet.

Préparez : la structure de votre protéine (fichier PDB) et, si applicable, la structure du ligand (PDB/MOL2/SDF). Indiquez-moi la durée souhaitée pour la simulation ou laissez-moi vous conseiller.

Envoyez-moi les détails de votre système pour un devis personnalisé, lançons votre simulation