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Je réaliserai une analyse épigénétique intégrative
Bioinformatique simplifiée
Analyste principal chez INTEGRATIVE BIOANALYTICS.
Je suis un bioinformaticien principal et ancien scientifique en laboratoire humide au Dana-Farber Cancer Institute et à UT Southwestern. Mes priorité...
À propos de ce service
Ce qui est inclus :
ATAC-seq / ChIP-seq / Cut & Run/Tag
Contrôle de qualité approfondi
Alignement + appel de pics (Bowtie2/MACS3)
Pics de consensus, chevauchement et signal.
Analyse différentielle des pics (DiffBind)
Visualisation : PCA, graphique en volcan interactif.
Annotation des pics génomiques (ChIPseeker)
Annotation fonctionnelle des pics (ENCODE-SCREEN)
Pistes du génome pour la visualisation (BigWig)
Annotation personnalisée avec des jeux de données d’intérêt.
Footprinting protéique basé sur des preuves (LOLA/ReMap2022)
Analyse de motifs connus et de novo (HOMER).
Analyse de voies basée sur les domaines régulateurs (GREAT)
Rapport biologique
Rapport QC
Rapport technique
Révisions mineures et consultation.
FAQ
Traduction automatique
Combien d’échantillons sont inclus ?
Jusqu'à 6 échantillons.
