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Je réaliserai une analyse bioinformatique et génomique des données en r et python
Développeur en bioinformatique et spécialiste en génétique et bioingénierie
En tant que diplômé en génétique et bioingénierie, je fais le pont entre les processus biotechnologiques en laboratoire humide et les pipelines informatiques en laboratoire sec. Je conçois des workflo...
À propos de ce service
Vous avez besoin d'une analyse bioinformatique claire et reproductible pour vos données de recherche ?
Je propose une analyse bioinformatique et génomique utilisant R et Python, en mettant l'accent sur des résultats statistiquement solides, des workflows reproductibles et des figures prêtes à publication.
Je peux vous aider avec :
Analyse RNA-seq et RNA-seq single-cell
Analyse de données génomiques et biologiques
Tests statistiques et interprétation des résultats
Nettoyage, intégration et contrôle de qualité des données
Graphiques et visualisations de qualité publication
Workflows reproductibles en R/Python
Modélisation prédictive interprétable lorsque cela est pertinent
Vous recevrez des résultats bien organisés, une documentation claire et un code pouvant être examiné ou réutilisé.
Ma méthode de travail est adaptée à votre jeu de données et à votre question de recherche plutôt que d'appliquer un pipeline universel.
Pour des projets complexes, volumineux ou personnalisés, veuillez me contacter avant de commander afin que nous puissions définir le périmètre et choisir le bon package.
Mon portfolio
FAQ
Traduction automatique
Quels types de données bioinformatiques pouvez-vous analyser ?
Je peux travailler avec des données RNA-seq, RNA-seq single-cell, intervalles génomiques, matrices d'expression, métadonnées et autres jeux de données biologiques structurés. Veuillez me contacter avant de commander si votre jeu de données ou type d'analyse est inhabituel.
Dois-je fournir les fichiers de séquençage bruts ?
Pas toujours. Je peux travailler avec des matrices de comptage traitées, des tableaux d'expression, des coordonnées génomiques, des métadonnées ou d'autres fichiers prêts pour l'analyse. Si vous avez uniquement des fichiers FASTQ ou BAM, contactez-moi d'abord pour que je puisse examiner le périmètre et les exigences en calcul.
Vais-je recevoir le code d'analyse ?
Oui. Selon le package, je peux fournir un code organisé en R ou Python avec les tableaux de résultats, figures et documentation pour que le workflow puisse être examiné et réutilisé.
Pouvez-vous créer des figures prêtes à être publiées ?
Oui. Je peux créer des figures claires, de qualité publication, et des visualisations statistiques adaptées à votre analyse et question de recherche.
Dois-je vous contacter avant de passer une commande ?
Oui, surtout pour des projets volumineux, complexes ou personnalisés. Envoyez-moi une brève description de votre question de recherche, du type de jeu de données, de la taille approximative et des livrables attendus pour que je puisse confirmer le meilleur package et le périmètre.
