Je vais effectuer un docking moléculaire, une simulation MD et une analyse ADMET

Bonjour,

Je suis un chercheur spécialisé en bioinformatique et chimie computationnelle. Si vous avez besoin d’un docking moléculaire, de simulations de dynamique moléculaire (MD) ou de profilage ADMET pour votre projet de recherche, mémoire ou article, je peux vous aider à le mettre en place et à le réaliser.

Je réalise des simulations en utilisant des GPU cloud haute performance (principalement GROMACS et AutoDock Vina) pour fournir des résultats rapides et précis.

Ce que je peux faire :

Docking moléculaire : docking protéine-ligand (AutoDock Vina, PyRx), docking ciblé ou aveugle, criblage virtuel et visualisation des poses (PyMOL/Discovery Studio).

Simulations MD : configuration du système, equilibration et simulations de production (de 10ns à plus de 100ns) avec GROMACS ou NAMD. J’analyserai RMSD, RMSF, Rg, SASA, liaisons hydrogène et énergie de liaison MM-PBSA.

ADMET et drug-likeness : profilage SwissADME/pkCSM et filtres selon la règle des cinq de Lipinski.

Modélisation par homologie : modélisation de la structure 3D des protéines (SWISS-MODEL/Modeller) et validation.

Ce que vous recevrez :

Un rapport de résultats clair et professionnel avec des figures prêtes à publier.

Tous les fichiers de sortie bruts (.pdbqt, .gro, .xtc, .xvg, etc.) pour vos archives.

Une section méthodologie écrite que vous pourrez facilement formater pour votre article ou mémoire.