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J'analyserai les données de séquençage des immunorécepteurs tcr bcr
Des solutions simples pour des données biomédicales complexes
Bonjour, je m'appelle Jonathan Alles. Je suis consultant indépendant en bioinformatique et ingénierie des données. Par l'intermédiaire de mon agence, EVOBYTE Digital Biology, j'accompagne les professi...
Niveau 1
Répond à certains critères de performance et présente un fort potentiel sur la place de marché.
À propos de ce service
Avez-vous besoin d’aide pour analyser, intégrer ou interpréter des données de séquençage immunorécepteur, provenant d’essais TCR ou BCR-seq (cellule unique) ?
Ce que je propose :
Analyse bioinformatique
- Traitement bioinformatique des données brutes de séquençage
- Regroupement, filtrage, nettoyage
- Annotation des métadonnées
- Alignement et quantification des séquences TCR/BCR
- Statistiques sur l’utilisation des gènes et comparaison statistique
- Suivi des TCR/BCR
- Regroupement de récepteurs
- Intégration avec des sources de données publiques (par exemple VDJ-DB)
Visualisation & rapport
- Notebook Jupyter incluant le code d’analyse
- Rapports personnalisés en PDF ou HTML
- Tableaux de bord pour la requête de données
Développement de pipeline & automatisation
- Automatisation et mise à l’échelle des pipelines d’analyse
- Intégration avec bases de données et cloud
- Containerisation
Curations de données
- Curations et assemblage de packages de données à partir de la littérature ou de dépôts publics
Technologies utilisées
Python / Pandas / scipy / Jupyter / TF / Bash / MiXCR / Packages Python pour la bioinformatique TCR/BCR
Construisons ensemble !
Vous avez un projet en tête ? Contactez-moi pour discuter de vos besoins, et je vous proposerai un plan et une offre personnalisés qui correspondent parfaitement à vos objectifs.
