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J'analyserai les données de séquençage d'ARN à cellule unique et de transcriptomique spatiale
Des solutions simples pour des données biomédicales complexes
Bonjour, je m'appelle Jonathan Alles. Je suis consultant indépendant en bioinformatique et ingénierie des données. Par l'intermédiaire de mon agence, EVOBYTE Digital Biology, j'accompagne les professi...
À propos de ce service
Vous avez besoin d’aide pour analyser, intégrer ou interpréter des données omiques à cellule unique ?
Je soutiens les équipes de recherche dans l’analyse de données pour le scRNA-Seq, l’analyse des récepteurs immunitaires à cellule unique ou la transcriptomique spatiale.
Des analyses personnalisées sont possibles : contactez-moi pour un devis.
Ce que je propose :
Analyse bioinformatique
- Traitement bioinformatique des données brutes de séquençage
- Agrégation, filtrage, nettoyage, correction de lot
- Importation de métadonnées
- Clustering et annotation de clusters
- Expression différentielle des gènes
- Inférence de trajectoire
- Analyse GSEA / termes GO
- Analyse du voisinage spatial
Visualisation & rapport
- Notebook Jupyter incluant le code d’analyse
- Rapports personnalisés en PDF ou HTML
- Tableaux de bord pour requêter les données
Développement de pipeline & automatisation
- Automatisation et mise à l’échelle des pipelines d’analyse
- Intégration avec bases de données et cloud
- Containerisation
Curations de données
- Collecte de données omiques (cellules uniques) pour une indication, modalité thérapeutique, espèce, etc.
- Extraction de sources de données publiques et bases de données pour retourner un jeu de données intégré
Technologies utilisées
Python / Pandas / scVerse / scipy / Jupyter / TF / Bash / Cell Rank / squidpy / scVelo
Construisons ensemble !
Vous avez un projet en tête ? Contactez-moi pour discuter de vos besoins, et je vous fournirai une solution personnalisée.
Mon portfolio
FAQ
Traduction automatique
Comment sont présentés les rapports d’analyse de données ?
Vous recevrez à la fois les scripts d’analyse en python ou notebooks Jupyter ainsi qu’un fichier de rapport et/ou une présentation expliquant l’analyse des données et les conclusions.
Avis
2 avis concernant ce service
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Détails de la notation
- Niveau de communication avec le freelance
- Qualité de la livraison
- Valeur de la livraison
Trier par
Les plus pertinents
J j_chem23
Canada
Extremely knowledgeable researcher with a high quality of work and professionalism. Reliable data analysis with easy to observe and digest results. Highly recommend.
400 $US-600 $US
Prix
8 jours
Durée
Utile?M matteobertelli
Italie
Jonathan Alles is an outstanding professional in the field of Data Analytics. His meticulous attention to detail, unwavering professionalism, and exemplary responsiveness greatly contributed to a smooth and efficient collaboration. The quality of his work is exceptional, and I would unreservedly recommend...
600 $US-800 $US
Prix
3 semaines
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