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J'analyserai les données transcriptomiques du cancer TCGA GEO et publiques
Doctorant en bioinformatique, séquençage RNA, génomique, biostatistique, R et Python
Je suis bioinformaticien avec un doctorat en bioinformatique et plus de 11 ans d'expérience en biologie computationnelle. J'utilise R et Python pour l'RNA-seq bulk et single-cell, ATAC-seq, WGS/WES, a...
Niveau 1
Répond à certains critères de performance et présente un fort potentiel sur la place de marché.
À propos de ce service
J'analyse des ensembles de données transcriptomiques du cancer publics provenant de TCGA, GEO et de dépôts de recherche similaires.
Les services peuvent inclure la revue des ensembles de données et des métadonnées, le prétraitement de l'expression, l'expression différentielle, l'analyse de survie, les associations avec les variables cliniques, la corrélation des gènes, l'enrichissement de voies, la comparaison des sous-groupes immunitaires ou moléculaires, et la validation inter-cohortes. Le flux de travail sera adapté à la question de recherche et aux informations disponibles dans chaque ensemble de données.
Vous recevrez les figures et tableaux de résultats convenus, un code reproductible en R ou Python si applicable, ainsi qu'une interprétation concise indiquant les principaux résultats et limitations.
Ce service est réservé à un usage de recherche et éducatif uniquement. Il ne fournit pas de diagnostic clinique, de recommandations de traitement ou d'interprétation médicale spécifique au patient.
Veuillez m'envoyer un message avant de commander avec le type de cancer, l'accès à l'ensemble de données ou l'étude, les gènes ou voies d'intérêt, les comparaisons prévues et les résultats souhaités.
Mon portfolio
FAQ
Traduction automatique
Pouvez-vous aider à choisir un dataset TCGA ou GEO adapté ?
Oui. Envoyez le type de cancer, la question biologique, les exigences en matière d'échantillons et le type de données préféré afin que je puisse évaluer les cohortes publiques appropriées.
Quelles analyses peuvent être incluses ?
Le champ d'application peut inclure l'expression différentielle, l'analyse de survie, la corrélation, l'enrichissement, la comparaison de sous-groupes, les associations avec les variables cliniques et la validation inter-cohortes.
Vais-je recevoir le code d'analyse ?
Oui, lorsque le code est inclus dans le package sélectionné. Je peux fournir des scripts reproductibles en R ou Python, des notebooks et des tableaux de résultats.
Fournissez-vous une interprétation clinique ?
Non. Ce service propose une analyse bioinformatique de recherche et ne fournit pas de diagnostic, de conseils de traitement ou d'interprétation médicale spécifique au patient.
