Je réaliserai une analyse rnaseq, atacseq ou scrnaseq avec une bioinformatique complète

Vous cherchez une analyse claire, pertinente et reproductible de vos données de séquençage ?

Je me spécialise dans l’analyse de données à haut débit, notamment RNA-seq, ATAC-seq et single-cell RNA-seq (scRNA-seq). Que vous travailliez avec des échantillons en vrac ou des jeux de données complexes de cellules uniques, je peux fournir un pipeline complet, du contrôle de qualité à l’analyse avancée en aval.

Je propose :

• Contrôle de qualité (FastQC, MultiQC)
• Alignement et quantification
• Analyse de l’expression différentielle/accessibilité
• Appel de pics (pour ATAC-seq)
• Réduction de dimension, clustering, typage cellulaire (pour scRNA-seq)
• Visualisation (heatmaps, PCA, volcans, UMAP/tSNE)
• Enrichissement fonctionnel (GO/KEGG)
• Graphiques personnalisés pour publication

Outils que j’utilise : R, Seurat, DESeq2, edgeR, MACS2, Galaxy, Bioconductor, Scanpy

Transformons vos données brutes en insights biologiques !