Je vais effectuer une analyse différentielle d'expression RNA-seq sur votre jeu de données

Êtes-vous un chercheur ou un scientifique avec des données RNA-seq

qui nécessite une analyse professionnelle ?

Je vais analyser votre jeu de données RNA-seq et identifier

les gènes différentiellement exprimés en utilisant DESeq2, en fournissant

des résultats prêts à être publiés.

CE QUE J’OFFRE :

- Alignement sur le génome de référence avec HISAT2

- Analyse de l’expression différentielle avec DESeq2

- Graphique volcano et heatmap des principaux DEGs

- Rapport d’analyse complet en HTML

- Scripts R et Python propres et documentés

LES LIVRABLES INCLUENT :

- Résultats d’expression différentielle avec DESeq2

- Analyse d’enrichissement des processus biologiques GO

- Analyse des voies Reactome avec voies cliniques

- Figures prêtes à être publiées

- Rapport HTML complet

MON EXPÉRIENCE :

J’ai créé un pipeline RNA-seq complet analysant des données génomiques de

cancer du sein provenant du dataset NCBI PRJNA432903. J’ai identifié 2298 DEGs significatifs avec

PC1 expliquant 86 % de la variance.

CE QUE J’AI BESOIN DE VOUS :

- Fichiers FASTQ bruts ou matrice de comptage pré-traitée

- Génome de référence ou nom de l’organisme

- Conditions expérimentales et informations sur les échantillons

OUTILS UTILISÉS :

R, DESeq2, HISAT2, featureCounts, Python, Bash,

Git, Linux, ggplot2, EnhancedVolcano

Commandez dès maintenant et recevez des résultats bioinformatiques précis et reproductibles

livrés sur