Je réaliserai une analyse scRNA-seq et annotation des types de cellules

Avez-vous des données de scRNA-seq qui nécessitent

une analyse professionnelle et une identification des types de cellules ?

J'analyserai votre jeu de données scRNA-seq en utilisant Seurat

et fournirai une annotation complète des types de cellules avec

des visualisations prêtes pour publication.

CE QUE VOUS OBTENEZ :

- Contrôle de qualité et filtrage des cellules de faible qualité

- Normalisation et mise à l’échelle

- Réduction de dimension PCA

- Clustering basé sur un graphe

- Visualisation UMAP

- Identification des gènes marqueurs par cluster

- Annotation biologique des types de cellules

- Rapport d’analyse complet

MON EXPÉRIENCE :

J'ai analysé 2 700 PBMC humains en identifiant 9 populations cellulaires distinctes

incluant les cellules T, B, NK, monocytes, cellules dendritiques et plaquettes en utilisant Seurat.

Pipeline complet disponible sur GitHub.

CE QUE J'AI BESOIN DE VOUS :

- Fichiers de sortie 10X Genomics (barcodes, features, matrix)

 OU matrice de comptage traitée

- Nom de l’organisme (humain, souris, etc.)

- Toute information biologique connue sur votre échantillon

OUTILS : R, Seurat, ggplot2, dplyr, UMAP,

    PCA, Git, Linux

Contactez-moi avant de commander pour discuter

de votre dataset. Je confirmerai d’abord la faisabilité.