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Je vais analyser des données bulk rna seq et expression génique
Analyste en bioinformatique, RNA seq, visualisation de données scientifiques
Analyste en bioinformatique spécialisé dans le bulk RNA-seq humain, l'analyse de l'expression génétique et la visualisation de données scientifiques. J'aide les chercheurs à transformer des matrices d...
À propos de ce service
Transformez vos données d'RNA-seq en vrac ou d'expression génique en résultats clairs, fiables et prêts à être publiés.
J’aide les chercheurs, laboratoires et équipes biotech à convertir des matrices d’expression complexes en insights biologiques bien organisés en utilisant des workflows R et Bioconductor adaptés à chaque conception d’étude.
Les services peuvent inclure :
- Vérification des entrées, métadonnées et identité des échantillons
- Contrôle de qualité, revue de la taille de la bibliothèque, PCA et diagnostics des échantillons
- Filtrage, normalisation et analyse différentielle de l’expression
- Tableaux de résultats complets, volcans et figures prêtes à publier
- Cartes de chaleur des DEG et analyse de voies GO, Reactome et KEGG
- Analyse de sensibilité et de concordance pour des projets avancés
- Méthodes claires, résumé des résultats et dossiers QA structurés
Vous recevrez des résultats soigneusement organisés, faciles à examiner, interpréter et utiliser dans des rapports, présentations, manuscrits ou analyses complémentaires. Je privilégie la clarté statistique, la visualisation de haute qualité et une communication transparente tout au long du projet.
Veuillez m’envoyer un message avant de commander afin que je puisse comprendre vos données, votre question de recherche et les comparaisons souhaitées.
Mon portfolio
FAQ
Traduction automatique
Quels fichiers dois-je fournir ?
Veuillez fournir une matrice de comptage ou d’expression au niveau des gènes, métadonnées d’échantillons, étiquettes de groupe, type d’ID de gène, et les comparaisons nécessaires. Une brève description de votre question de recherche est également utile.
Traitez-vous les fichiers FASTQ bruts ?
Ce service se concentre sur l’analyse en aval des matrices de comptage au niveau des gènes ou des matrices d’expression validées. Le contrôle de qualité brut FASTQ, l’alignement et la quantification nécessitent une portée personnalisée séparée.
Quel forfait dois-je choisir ?
La formule de base couvre le contrôle de qualité ciblé et l’expression différentielle. La formule standard ajoute diagnostics, carte de chaleur DEG et analyse de voies. La formule premium supporte des études plus grandes, jusqu’à deux contrastes, analyse de sensibilité et QA étendue.
Les scripts R ou Python sont-ils inclus ?
Les scripts et notebooks reproductibles R ou Python ne sont pas inclus par défaut. Ils peuvent être fournis en option payante après examen des données, de l’environnement et de la portée du code requis.
Pouvez-vous analyser des conceptions d’étude appariées ou complexes ?
Oui, les comparaisons simples appariées et non appariées sont supportées dans le package approprié. Les conceptions multi-factorielles, d’interaction, longitudinales ou autres nécessitent une revue de faisabilité et une offre personnalisée.
Pouvez-vous garantir des gènes ou voies significatifs ?
La signification statistique dépend des données, de la taille de l’échantillon et de l’effet biologique. Je fournis des résultats complets, transparents et rapporte clairement les résultats significatifs et non significatifs.
Que vais-je recevoir ?
Selon votre package, vous recevrez des tableaux de résultats organisés, des figures haute résolution, méthodes, un résumé des résultats et des dossiers QA. Les packages avancés incluent des analyses de voies et de sensibilité.
Que couvre une révision ?
Une révision couvre les corrections, modifications de format ou clarifications dans le cadre de l’analyse convenue. De nouveaux jeux de données, comparaisons, méthodes ou modules d’analyse nécessitent une option ou une offre personnalisée.
