J'annoterai les génomes et protéines de phage

Annotation de génomes et protéines de phage

Vous avez un génome de bactériophage ou des séquences de protéines qui nécessitent une annotation bioinformatique professionnelle ? Je peux vous aider à identifier les gènes, prédire les fonctions des protéines et caractériser votre génome de phage en utilisant des outils et bases de données bioinformatiques établis.

Les services incluent :

Annotation de génome de phage et prédiction d'ORF/CDS

Identification des gènes et annotation fonctionnelle

Prédiction de la fonction des protéines de phage

Analyse de similarité basée sur BLAST

Identification de domaines conservés et de familles de protéines

Identification de protéines structurales, de réplication, de lyse et de métabolisme de l'ADN

Caractérisation de protéines hypothétiques

Identification de tRNA et autres caractéristiques génomiques

Analyse comparative des génomes de phage

Cartes du génome et tableaux d'annotation

Outils/Bases de données : NCBI BLAST, HMMER, Pfam, InterPro, UniProt, PHROGs, Prokka, PHANOTATE, VIBRANT et autres ressources pertinentes.

Livrables : Génome annoté, tableau d'annotation des protéines, classification fonctionnelle, résultats d'analyse, résumé des caractéristiques du génome et figures/tableaux prêts pour publication si applicable.

Contactez-moi avant de commander pour discuter de votre génome, de vos séquences de protéines ou de besoins spécifiques en recherche.