Je vais effectuer une analyse de docking moléculaire et de simulation MD

Vous avez besoin d’un docking moléculaire ou d’une simulation MD précis, avec des résultats que vous pouvez réellement interpréter et défendre ?

Je possède un master en virologie moléculaire et une licence en bioinformatique. Mon travail de mémoire portait sur le criblage virtuel, le docking moléculaire et la simulation de dynamique moléculaire pour évaluer des inhibiteurs candidats contre des cibles protéiques liées à des maladies, donc je comprends la biologie derrière les chiffres, pas seulement comment utiliser le logiciel.

Outils avec lesquels je travaille :

• AutoDock Vina, Discovery Studio (docking moléculaire et criblage virtuel)
• GROMACS (simulation de dynamique moléculaire)
• PyMOL et UCSF Chimera, Chimera X (visualisation structurale)

Je propose :

• Criblage virtuel de bibliothèques de composés contre une cible
• Docking protéine-ligand avec visualisation de la pose de liaison
• Analyse des interactions en 2D et 3D
• Simulation MD (généralement jusqu’à 10-20 ns) avec analyse RMSD, RMSF, liaisons H et rayon de giration
• Rapport écrit clair expliquant la méthodologie et les résultats

Contactez-moi avant de commander pour discuter de votre cible, ligand(s), et du package adapté à votre projet. Les systèmes plus grands ou les simulations plus longues peuvent faire l’objet d’une commande personnalisée.