Je réaliserai une analyse à grande échelle de la génomique du cancer et des mutations

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Nazia A

Pakistan

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Découvrez les insights génomiques avec une analyse experte des données NGS, analyse d’imagerie médicale

Analyste en bioinformatique et imagerie médicale avec une expertise en analyse de mutations cancéreuses NGS, RNA-Seq en masse, scRNA-Seq, profilage de l’expression génique, analyse de voies, identific...
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À propos de ce service

Que vous ayez besoin d’un soutien pour un projet de recherche, une thèse, un manuscrit, une proposition de subvention ou une investigation en biotechnologie, je peux fournir une analyse fiable et reproductible du génome du cancer.

Je suis chercheur en bioinformatique spécialisé en génomique du cancer, NGS et analyse multi-cohort à grande échelle. Je vous aiderai à analyser les mutations somatiques à partir de jeux de données du génome du cancer en utilisant des workflows de bioinformatique de pointe.

Services proposés :

  • Analyse de données NGS.
  • Profilage des mutations à travers différentes cohortes de cancer.
  • Identification des gènes moteurs.
  • Analyse des gènes significativement mutés.
  • Développement de pipelines personnalisés avec R, Perl, Java et shell Linux.
  • Analyse de la fréquence des mutations.

Pourquoi me choisir ?

  • Doctorat en bioinformatique.
  • Publications dans des revues à fort impact (NAR, BMC).
  • Professionnel, livraison dans les délais.

Outils et technologies

  • Samtools, Bedtools.
  • Contrôle de qualité (FastQC, MultiQC).
  • Trimming des lectures (Trimmomatic, Cutadapt).
  • Alignement (BWA, Bowtie2, STAR, HISAT2).
  • Appel de variants (GATK, FreeBayes, DeepVariant).
  • Annotation fonctionnelle (ANNOVAR, VEP, SnpEff).
  • Visualisation (IGV, Circos).
  • Automatisation des workflows (Snakemake, Nextflow).

Livrables

  • Jeux de données traités et propres.
  • Figures de qualité publication.
  • Rapport d’analyse détaillé.
  • Scripts reproductibles (R/Python).
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