Je vais effectuer une analyse différentielle d'expression rnaseq avec deseq2 ou edger

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Nitchawat

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Je vais analyser vos données proteomiques LC MSMS et livrer des résultats pour publication

Chercheur universitaire spécialisé en proteomique LC-MS/MS, transcriptomique et intégration multi-omiques. Je publie dans des revues comme Scientific Reports (Nature) et je travaille quotidiennement a...
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À propos de ce service

Vous avez besoin d'aide avec vos données RNA-seq ? Je suis chercheur universitaire publié dans Scientific Reports (Nature), spécialisé dans l'analyse multi-omique pour la découverte de biomarqueurs.


Je travaille quotidiennement avec DESeq2, edgeR et limma, pas seulement pour des comparaisons entre deux groupes, mais aussi pour des designs complexes : échantillons appariés, séries temporelles, expériences à facteurs multiples et effets de lot.


Ce que je propose :

Filtrage de qualité et normalisation

Analyse différentielle d'expression (DESeq2/edgeR)

Graphiques volcano, heatmaps, MA, PCA de qualité publication

Analyse d'enrichissement de jeux de gènes et de voies (GO, KEGG, GSEA)

Scripts R inclus dans les forfaits Standard & Premium


Je travaille avec : matrices de comptage provenant de featureCounts, HTSeq, STAR, Salmon ou tout pipeline standard.


Note : le forfait de base couvre uniquement le QC et l'analyse exploratoire, sans test différentiel.

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Technologie:

RStudio

•

Autres

Type d'analyse:

Analyse quantitative

•

Analyse statistique

+2

Expertise:

Conception expérimentale

•

Statistiques

Langage de programmation:

Python

•

R

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