Je vais construire un arbre phylogénétique et analyser vos séquences de gènes AMR

Avez-vous du mal à visualiser les relations évolutives de vos gènes de résistance antimicrobienne (AMR) ? Je suis étudiant en Master de biochimie et biologie moléculaire avec une expérience pratique en diagnostics moléculaires en santé publique. Je combine ma compréhension approfondie de la biologie avec des pipelines bioinformatiques automatisés pour vous fournir une analyse phylogénétique prête à publication.

Ce que je ferai pour vous :

• Récupération automatisée de séquences depuis NCBI (ou travail avec vos fichiers FASTA fournis).
• Alignement multiple de séquences avec Clustal Omega.
• Construction d’un arbre phylogénétique (Neighbor-Joining) avec 100 réplicats bootstrap.
• Un rapport PDF clair d’une page interprétant la signification biologique (par exemple, preuve de transfert horizontal de gènes ou d’expansion clonale).
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Pourquoi me choisir ?

Je ne me contente pas de cliquer sur des boutons dans un logiciel. J’écris des scripts Python (Biopython) qui garantissent que votre analyse est reproductible et rapide. Mon expérience en laboratoire dans les tests de susceptibilité aux antibiotiques (AST) et la PCR signifie que je comprends le contexte clinique de vos gènes de résistance, pas seulement le code.

Livrables :

• Une image d’arbre en haute résolution.
• Le fichier FASTA aligné.
• Un rapport PDF avec la méthodologie complète et l’interprétation.