J'exécuterai le docking moléculaire et des simulations de dynamique moléculaire

Je propose des services professionnels de simulations de dynamique moléculaire (MD) à l’aide de GROMACS pour la biologie computationnelle, la découverte de médicaments et les études d’interaction protéine-ligand. Mon objectif est de comprendre la stabilité des protéines, les interactions moléculaires et la dynamique structurelle au moyen de workflows computationnels fiables et d’analyses scientifiques.

Mes services incluent

1. Configuration de la simulation MD : préparation du système protéine et protéine-ligand, sélection du champ de force, solvatisation, ajout d’ions, minimisation d’énergie et équilibration.
2. Simulation de dynamique moléculaire : MD de production pour étudier la stabilité des protéines, les changements conformationnels et les interactions protéine-ligand.
3. Analyse des trajectoires : RMSD, RMSF, rayon de gyration (Rg), surface accessible au solvant (SASA), analyse des ponts hydrogène et évaluation de la stabilité structurale.
4. Rapport scientifique : graphiques de qualité publication, visualisation moléculaire, interprétation des résultats et organisation des données computationnelles.

Outils et logiciels

GROMACS, PyMOL, UCSF Chimera et outils d’analyse moléculaire associés, selon les exigences du projet.

Livrables

• Graphiques et figures d’analyse de trajectoire MD
• Analyse structurelle et des interactions et rapport

Veuillez me contacter avant de commander.