Je réaliserai un docking moléculaire et une dynamique moléculaire

Réalisez-vous des recherches en découverte de médicaments, inhibition enzymatique ou analyse d’interactions protéine-ligand ?

Je propose des services professionnels de docking moléculaire combinés à une simulation de dynamique moléculaire (MD) de base jusqu’à 1 nanoseconde (1 ns) pour évaluer la stabilité des complexes dockés. Mon processus de travail suit les protocoles standard de la découverte de médicaments par calcul, adaptés à un usage académique et de recherche.

Services de docking moléculaire :

• Préparation des protéines et ligands
• Identification du site actif et optimisation de la grille
• Docking avec AutoDock Vina
• Affinité de liaison
• Visualisation des interactions en 3D
• Images haute résolution, prêtes pour publication

Simulation de dynamique moléculaire de base (jusqu’à 1 ns) :

Pour valider davantage les résultats du docking, je propose une analyse préliminaire de stabilité MD, comprenant :

• Préparation du système et solvatation
• Minimisation de l’énergie
• Équilibrage (NVT/NPT)
• Exécution de la simulation jusqu’à 1 ns
• RMSD
• RMSF
• Analyse des liaisons hydrogène
• Graphiques et diagrammes clairs, prêts pour rapports ou publications

Idéal pour

• Projets de recherche BS / MS / PhD
• Soutien à la rédaction de thèses ou mémoires
• Préparation à la publication dans des revues
• Études de découverte de médicaments par calcul

Veuillez me contacter avant de passer commande pour discuter de votre projet.

Merci de votre visite.