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Je vais effectuer des simulations de docking moléculaire et de dynamique moléculaire
Étude DFT des matériaux : modélisation et simulation de cellule solaire, photodétecteur
Auteur de plusieurs articles de recherche indexés dans Scopus :
Expertise en étude computationnelle basée sur DFT de nouveaux matériaux : dopage, simulations de dynamique moléculaire, investigation de...
Niveau 1
Répond à certains critères de performance et présente un fort potentiel sur la place de marché.
À propos de ce service
Je propose des services professionnels de docking moléculaire et de simulation de dynamique moléculaire (MD) pour la recherche académique, pharmaceutique et industrielle.
J’aide à analyser les interactions protéine-ligand, l’affinité de liaison, la stabilité et le comportement structural en utilisant des outils informatiques standards.
Logiciels que j’utilise :
AutoDock Vina, Discovery Studio, PyMOL, GROMACS, Open Babel, Avogadro, AutoDock Tools.
Services inclus :
- Préparation des protéines (nettoyage, sélection de chaîne, conversion de format)
- Préparation du ligand et optimisation de la géométrie
- Conversion de fichiers (PDB, PDBQT, SDF, MOL2)
- Configuration de la grille et docking moléculaire
- Analyse de l’affinité de liaison (ΔG) et des interactions
- Visualisation 2D/3D des complexes dockés
- Simulations de dynamique moléculaire
- Analyse RMSD, RMSF, rayon de giration, liaisons H
- Stabilité du complexe et analyse de trajectoire
- Figures et rapports de qualité publication
- Explications adaptées aux débutants si nécessaire
Pourquoi me choisir ?
- Flux de travail précis
- Résultats axés sur la recherche
- Communication rapide
- Gestion confidentielle des données
Veuillez me contacter avant de commander pour discuter de vos besoins de projet.
Type de service:
Recherches
Langue:
Anglais
Préférence du type de livraison
Veuillez informer le freelance de toute préférence ou préoccupation concernant l'utilisation d'outils d'IA dans la réalisation et/ou la livraison de votre commande.
Le travail académique à réaliser à votre place est contraire à l'éthique puisqu'il viole la plupart des codes d'honneur des écoles.
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FAQ
Traduction automatique
De quoi avez-vous besoin de moi pour démarrer le projet ?
Veuillez envoyer votre structure de protéine (ID PDB ou fichier), la structure du ligand (SDF/MOL2/PDB), les informations sur la cible et les objectifs du projet. Si vous n'êtes pas sûr, je peux vous guider sur les fichiers nécessaires.
Que vais-je recevoir après un docking moléculaire ou une simulation MD ?
Vous recevrez des scores de docking, une analyse des interactions de liaison, des visualisations 2D/3D du complexe, une interprétation des résultats et des fichiers de sortie. Pour les simulations MD, vous pouvez également obtenir des graphiques d’analyse RMSD, RMSF, rayon de giration, liaison hydrogène et stabilité.
Pouvez-vous aider les débutants, étudiants ou chercheurs en thèse ?
Oui. Je propose des explications adaptées aux débutants et des rapports clairs, adaptés aux étudiants, chercheurs, travaux de thèse, publications et présentations académiques.
