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Je vais effectuer une analyse de DEG et de voie en bulk rnaseq
Bioinformatique, génomique, R, Python, ML et rédaction scientifique
Je suis Saad, spécialiste en bioinformatique et biologie computationnelle, axé sur la génomique végétale, l’annotation du génome, RNA-seq, analyse de données, R, Python et rédaction scientifique. Via ...
À propos de ce service
Bienvenue sur mon service,
Recherchez-vous une analyse de bulk RNA-seq précise, reproductible et prête à être publiée ?
Je propose une analyse personnalisée de données transcriptomiques pour chercheurs, laboratoires et professionnels de la biotechnologie. Je peux travailler avec des matrices de comptage brutes ou des fichiers FASTQ selon le package choisi.
Les services peuvent inclure :
- Contrôle de qualité des FASTQ et rapport MultiQC
- Trimming des lectures, alignement ou quantification des transcripts
- Génération de comptages au niveau des gènes
- Normalisation, PCA et corrélation entre échantillons
- Analyse de l’expression différentielle
- Graphiques volcano, MA et heatmaps
- Enrichissement GO et voies
- Figures prêtes pour publication et tableaux de résultats
- Scripts R et rapport d’interprétation clair
J’utilise des outils établis tels que FastQC, MultiQC, STAR, HISAT2, Salmon, DESeq2, edgeR et clusterProfiler sur un environnement Linux.
Veuillez me contacter avant de commander pour les fichiers FASTQ bruts, organismes non modèles, designs complexes ou plus de 12 échantillons. Les résultats dépendent de la qualité des données et du design expérimental.
Mon portfolio
FAQ
Traduction automatique
Acceptez-vous les fichiers FASTQ bruts ?
Oui. Le traitement des FASTQ est inclus dans le package Premium ou peut être fourni via une offre personnalisée. Veuillez envoyer le nombre d’échantillons, le type de séquençage et la taille approximative des fichiers avant de commander.
Pouvez-vous analyser une matrice de comptage existante ?
Oui. Veuillez fournir la matrice de comptage entière, les métadonnées des échantillons et les comparaisons que vous souhaitez effectuer.
Quels organismes pouvez-vous analyser ?
Je peux analyser des jeux de données végétaux, microbiens, animaux et humains lorsque des génomes de référence, transcriptomes et ressources d’annotation appropriés sont disponibles.
Fournirez-vous des figures prêtes pour publication ?
Oui. Les figures peuvent être livrées en format PNG, TIFF, PDF ou SVG selon votre package choisi et les exigences de publication.
Fournirez-vous le code d’analyse ?
Les scripts d’analyse sont inclus dans les packages Standard et Premium. Ils peuvent également être ajoutés au package Basic en option.
Garantissez-vous des gènes ou voies significatifs ?
Non. Les résultats dépendent de la qualité des échantillons, de la profondeur de séquençage, de la variation biologique et du design expérimental. Je fournis une analyse transparente sans manipuler ou fabriquer les résultats.
