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Je réaliserai des transcriptomiques et des modélisations qsar
Chercheur en biologie computationnelle et bioinformatique | Multi-omics | Python, R
Expert en bioinformatique spécialisé en scripting Python, R et Bash, avec une forte orientation vers des solutions computationnelles basées sur la recherche. Expertise en apprentissage automatique, in...
À propos de ce service
Je propose une analyse transcriptomique rigoureuse, prête pour publication, allant des matrices de comptage brutes à l’interprétation biologique en utilisant DESeq2, WGCNA et des outils d’enrichissement de voies dans R et Python.
Je propose :
- Analyse d’expression différentielle : DESeq2, limma, edgeR
- WGCNA : construction de réseaux de co-expression, identification de gènes clés, corrélation avec les traits
- Enrichissement de voies : GO, KEGG, Reactome avec clusterProfiler
- ssGSEA : infiltration de cellules immunitaires et scoring de jeux de gènes
- Gestion de datasets GEO : récupération, prétraitement, normalisation
- Visualisation : diagrammes volcano, heatmaps, PCA, pheatmap, ggplot2
- Intégration avec des pipelines de découverte de médicaments ou de pharmacologie réseau
Compétences :
- R · DESeq2 · WGCNA · limma · clusterProfiler · ggplot2 · pheatmap
- Python · Pandas · matplotlib · seaborn
- GEO · TCGA · KEGG · Reactome · GO
Pourquoi me choisir :
- Expérience pratique avec de vrais datasets transcriptomiques de COPD et de cancer
- Scripts R propres et annotés livrés avec chaque commande
- Figures formatées selon les normes de soumission aux revues
- Réactivité et attention aux détails tout au long du projet
- À l’aise avec la gestion de datasets GEO complexes et réels
Technologie:
Excel
•
Google Sheets
•
Jupyter Notebook
•
Pandas
•
RStudio
Expertise:
Statistiques
Langage de programmation:
Python
•
R
Mon portfolio
FAQ
Traduction automatique
Je n'ai pas de script précis en tête, juste un problème. Pouvez-vous quand même m'aider ?
Oui — envoyez-moi un message avec vos données et ce que vous cherchez à comprendre, et je vous proposerai la meilleure approche avant que vous passiez commande. Il n'est pas nécessaire de connaître les détails techniques vous-même.
Conserverez-vous mes données et mes recherches confidentielles ?
Oui. Vos données, votre idée de recherche et vos résultats ne sont jamais partagés, réutilisés ou discutés avec qui que ce soit. Cela reste strictement entre nous.
Je ne suis pas très expérimenté en codage — vais-je comprendre le script final ?
Oui. J'écris un code propre, commenté et j'explique les résultats en langage simple, pas seulement avec du jargon technique. Vous comprendrez ce que fait le script et pourquoi.
Pouvez-vous travailler avec ma base de données ou mon dataset spécifique (GEO, ChEMBL, PDB, NCBI, etc.) ?
Oui, je travaille régulièrement avec toutes les principales bases de données biologiques. Mentionnez simplement laquelle dans votre message et je vous confirmerai que je peux la gérer.
Avez-vous besoin de mon jeu de données complet avant de commander, ou puis-je l'envoyer après ?
Les deux options sont possibles. Si vous m'envoyez d'abord un échantillon ou une description de vos données, je peux confirmer la portée et le délai avant que vous passiez commande — cela évite toute surprise.
Est-ce réservé uniquement aux étudiants ou travaillez-vous aussi avec des chercheurs et des entreprises ?
Je travaille avec tout le monde — étudiants, chercheurs en doctorat, professeurs et entreprises. La portée et les forfaits s'ajustent à la complexité de votre projet.
