Je rédigerai des scripts en python et r pour la bioinformatique

Je rédige des scripts Python pour des problèmes de biologie et de bioinformatique

Les données biologiques ne devraient pas ralentir votre recherche.

Je suis chercheur en biologie computationnelle avec une expérience pratique dans la création de pipelines Python pour la découverte de médicaments, la transcriptomique et l'apprentissage automatique, y compris deux manuscrits en préparation en tant que premier auteur. Je réalise des scripts Python propres, bien documentés, qui abordent de vrais problèmes de bioinformatique, afin que vous obteniez des résultats que vous pouvez réellement utiliser et comprendre.

Je propose :

• Analyse de séquences : alignement d’ADN, d’ARN et de protéines, extraction de caractéristiques
• Traitement de données génomiques : gestion de données NGS, annotation de variants et assemblage
• Bioinformatique structurale : récupération, analyse et visualisation de structures de protéines
• Phylogénie : analyse des relations évolutives et construction d’arbres
• Systèmes biologiques : cartographie de voies et analyse de réseaux biologiques
• Visualisation de données : graphiques prêts pour publication pour données biologiques et génomiques
• Métagénomique : profilage de communautés microbiennes et analyse de la diversité
• Transcriptomique : analyse de l’expression génique et workflows pour l’expression différentielle
• Apprentissage automatique : prédiction de bioactivité, classification d’échantillons et modélisation QSAR

Compétences :

• Python · Biopython · NumPy · Pandas