Je réaliserai une analyse d'expression différentielle et d'enrichissement dans R

Biologie informatique en aval professionnelle : analyse de données et visualisations de qualité publication dans R.

Je traite des matrices brutes de comptage d’expression génétique, des tableaux de microarray ou des listes DEG pré-calculées pour effectuer des tests statistiques rigoureux et créer des figures prêtes pour la publication dans des revues à fort impact.

Packages et tarifs : - Basique (10 $ / 2 jours) : 1 analyse de DEG par contraste (DESeq2/limma/edgeR). Comprend un volcan plot (EnhancedVolcano), un graphique PCA des échantillons, une heatmap des principaux DEG (pheatmap), des tableaux récapitulatifs et un script R reproductible. - Standard (20 $ / 4 jours) : 1 DEG par contraste + enrichment fonctionnel. Tous les livrables Basique plus l’enrichissement GO (BP/MF/CC) et les voies KEGG via clusterProfiler. Dotplots, barplots et cnetplots inclus. - Premium (40 $ / 7 jours) : jusqu’à 2 contrastes de DEG + enrichment GO, KEGG et GSEA. Figures de publication fortement personnalisées (PDF vectoriel et PNG 600 DPI) avec palettes de couleurs, annotations des gènes et script R entièrement commenté.

Exigences d’entrée : Matrice de comptage brute ou tableau d’expression normalisé avec la feuille de métadonnées des échantillons correspondante (groupe et covariables).

Limites du champ : Analyse en aval uniquement ; usage recherche uniquement. Délai rapide et résumé en anglais clair inclus.